Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSI3

FAM53A, Protein FAM53A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53AQ6NSI3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM53AQ6NSI3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM53AQ6NSI3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM53AQ6NSI3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM53AQ6NSI3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM53AQ6NSI3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM53AQ6NSI3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM53AQ6NSI3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM53AQ6NSI3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM53AQ6NSI3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FAM53AQ6NSI3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM53AQ6NSI3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM53AQ6NSI3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM53AQ6NSI3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM53AQ6NSI3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM53AQ6NSI3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM53AQ6NSI3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM53AQ6NSI3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM53AQ6NSI3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM53AQ6NSI3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM53AQ6NSI3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM53AQ6NSI3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM53AQ6NSI3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM53AQ6NSI3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM53AQ6NSI3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM53AQ6NSI3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM53AQ6NSI3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM53AQ6NSI3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM53AQ6NSI3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM53AQ6NSI3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM53AQ6NSI3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM53AQ6NSI3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM53AQ6NSI3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM53AQ6NSI3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM53AQ6NSI3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM53AQ6NSI3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM53AQ6NSI3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM53AQ6NSI3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM53AQ6NSI3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM53AQ6NSI3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM53AQ6NSI3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM53AQ6NSI3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM53AQ6NSI3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM53AQ6NSI3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM53AQ6NSI3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM53AQ6NSI3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM53AQ6NSI3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM53AQ6NSI3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM53AQ6NSI3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM53AQ6NSI3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM53AQ6NSI3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM53AQ6NSI3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM53AQ6NSI3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM53AQ6NSI3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM53AQ6NSI3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM53AQ6NSI3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM53AQ6NSI3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM53AQ6NSI3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM53AQ6NSI3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM53AQ6NSI3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM53AQ6NSI3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM53AQ6NSI3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM53AQ6NSI3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM53AQ6NSI3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM53AQ6NSI3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM53AQ6NSI3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM53AQ6NSI3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM53AQ6NSI3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM53AQ6NSI3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM53AQ6NSI3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM53AQ6NSI3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM53AQ6NSI3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM53AQ6NSI3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM53AQ6NSI3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM53AQ6NSI3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM53AQ6NSI3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM53AQ6NSI3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM53AQ6NSI3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM53AQ6NSI3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM53AQ6NSI3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM53AQ6NSI3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM53AQ6NSI3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM53AQ6NSI3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM53AQ6NSI3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM53AQ6NSI3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM53AQ6NSI3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM53AQ6NSI3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53AQ6NSI3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53AQ6NSI3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM53AQ6NSI3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM53AQ6NSI3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM53AQ6NSI3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM53AQ6NSI3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM53AQ6NSI3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM53AQ6NSI3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM53AQ6NSI3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM53AQ6NSI3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53AQ6NSI3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53AQ6NSI3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM53AQ6NSI3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms