Protein–RNA interactions for Protein: Q6ISB3

GRHL2, Grainyhead-like protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL2Q6ISB3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRHL2Q6ISB3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRHL2Q6ISB3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRHL2Q6ISB3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRHL2Q6ISB3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRHL2Q6ISB3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRHL2Q6ISB3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRHL2Q6ISB3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRHL2Q6ISB3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRHL2Q6ISB3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRHL2Q6ISB3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRHL2Q6ISB3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRHL2Q6ISB3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRHL2Q6ISB3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRHL2Q6ISB3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRHL2Q6ISB3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRHL2Q6ISB3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRHL2Q6ISB3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GRHL2Q6ISB3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRHL2Q6ISB3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRHL2Q6ISB3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRHL2Q6ISB3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRHL2Q6ISB3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRHL2Q6ISB3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRHL2Q6ISB3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRHL2Q6ISB3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRHL2Q6ISB3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRHL2Q6ISB3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRHL2Q6ISB3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRHL2Q6ISB3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRHL2Q6ISB3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRHL2Q6ISB3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GRHL2Q6ISB3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRHL2Q6ISB3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GRHL2Q6ISB3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GRHL2Q6ISB3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GRHL2Q6ISB3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GRHL2Q6ISB3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRHL2Q6ISB3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRHL2Q6ISB3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRHL2Q6ISB3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRHL2Q6ISB3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRHL2Q6ISB3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRHL2Q6ISB3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GRHL2Q6ISB3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRHL2Q6ISB3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRHL2Q6ISB3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRHL2Q6ISB3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRHL2Q6ISB3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRHL2Q6ISB3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRHL2Q6ISB3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRHL2Q6ISB3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRHL2Q6ISB3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRHL2Q6ISB3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRHL2Q6ISB3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRHL2Q6ISB3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRHL2Q6ISB3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRHL2Q6ISB3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRHL2Q6ISB3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRHL2Q6ISB3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRHL2Q6ISB3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRHL2Q6ISB3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRHL2Q6ISB3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRHL2Q6ISB3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRHL2Q6ISB3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRHL2Q6ISB3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRHL2Q6ISB3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRHL2Q6ISB3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRHL2Q6ISB3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRHL2Q6ISB3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRHL2Q6ISB3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GRHL2Q6ISB3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRHL2Q6ISB3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRHL2Q6ISB3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRHL2Q6ISB3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
GRHL2Q6ISB3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRHL2Q6ISB3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRHL2Q6ISB3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRHL2Q6ISB3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRHL2Q6ISB3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRHL2Q6ISB3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRHL2Q6ISB3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRHL2Q6ISB3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRHL2Q6ISB3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRHL2Q6ISB3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRHL2Q6ISB3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRHL2Q6ISB3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRHL2Q6ISB3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRHL2Q6ISB3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRHL2Q6ISB3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GRHL2Q6ISB3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GRHL2Q6ISB3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRHL2Q6ISB3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRHL2Q6ISB3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GRHL2Q6ISB3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRHL2Q6ISB3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRHL2Q6ISB3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRHL2Q6ISB3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GRHL2Q6ISB3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GRHL2Q6ISB3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms