Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAPRIN2Q6IMN6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAPRIN2Q6IMN6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPRIN2Q6IMN6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPRIN2Q6IMN6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPRIN2Q6IMN6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPRIN2Q6IMN6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPRIN2Q6IMN6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPRIN2Q6IMN6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPRIN2Q6IMN6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CAPRIN2Q6IMN6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CAPRIN2Q6IMN6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPRIN2Q6IMN6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPRIN2Q6IMN6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPRIN2Q6IMN6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPRIN2Q6IMN6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPRIN2Q6IMN6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPRIN2Q6IMN6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPRIN2Q6IMN6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPRIN2Q6IMN6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAPRIN2Q6IMN6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAPRIN2Q6IMN6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAPRIN2Q6IMN6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPRIN2Q6IMN6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPRIN2Q6IMN6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPRIN2Q6IMN6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPRIN2Q6IMN6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPRIN2Q6IMN6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPRIN2Q6IMN6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPRIN2Q6IMN6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPRIN2Q6IMN6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPRIN2Q6IMN6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPRIN2Q6IMN6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPRIN2Q6IMN6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPRIN2Q6IMN6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPRIN2Q6IMN6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPRIN2Q6IMN6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CAPRIN2Q6IMN6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPRIN2Q6IMN6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPRIN2Q6IMN6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPRIN2Q6IMN6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPRIN2Q6IMN6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAPRIN2Q6IMN6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPRIN2Q6IMN6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPRIN2Q6IMN6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPRIN2Q6IMN6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPRIN2Q6IMN6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPRIN2Q6IMN6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPRIN2Q6IMN6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPRIN2Q6IMN6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPRIN2Q6IMN6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPRIN2Q6IMN6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPRIN2Q6IMN6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPRIN2Q6IMN6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPRIN2Q6IMN6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPRIN2Q6IMN6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPRIN2Q6IMN6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPRIN2Q6IMN6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPRIN2Q6IMN6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPRIN2Q6IMN6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPRIN2Q6IMN6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPRIN2Q6IMN6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPRIN2Q6IMN6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPRIN2Q6IMN6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPRIN2Q6IMN6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPRIN2Q6IMN6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPRIN2Q6IMN6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPRIN2Q6IMN6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPRIN2Q6IMN6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPRIN2Q6IMN6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPRIN2Q6IMN6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPRIN2Q6IMN6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPRIN2Q6IMN6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPRIN2Q6IMN6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPRIN2Q6IMN6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPRIN2Q6IMN6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPRIN2Q6IMN6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPRIN2Q6IMN6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPRIN2Q6IMN6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPRIN2Q6IMN6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPRIN2Q6IMN6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPRIN2Q6IMN6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPRIN2Q6IMN6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPRIN2Q6IMN6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPRIN2Q6IMN6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPRIN2Q6IMN6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
CAPRIN2Q6IMN6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPRIN2Q6IMN6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPRIN2Q6IMN6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPRIN2Q6IMN6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPRIN2Q6IMN6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPRIN2Q6IMN6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPRIN2Q6IMN6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPRIN2Q6IMN6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPRIN2Q6IMN6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPRIN2Q6IMN6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPRIN2Q6IMN6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPRIN2Q6IMN6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms