Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQ64

LY6G6F, Lymphocyte antigen 6 complex locus protein G6f, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6G6FQ5SQ64 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LY6G6FQ5SQ64 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LY6G6FQ5SQ64 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LY6G6FQ5SQ64 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LY6G6FQ5SQ64 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LY6G6FQ5SQ64 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LY6G6FQ5SQ64 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LY6G6FQ5SQ64 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LY6G6FQ5SQ64 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LY6G6FQ5SQ64 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LY6G6FQ5SQ64 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LY6G6FQ5SQ64 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LY6G6FQ5SQ64 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LY6G6FQ5SQ64 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LY6G6FQ5SQ64 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LY6G6FQ5SQ64 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LY6G6FQ5SQ64 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LY6G6FQ5SQ64 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LY6G6FQ5SQ64 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LY6G6FQ5SQ64 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LY6G6FQ5SQ64 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LY6G6FQ5SQ64 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LY6G6FQ5SQ64 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LY6G6FQ5SQ64 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LY6G6FQ5SQ64 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LY6G6FQ5SQ64 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LY6G6FQ5SQ64 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LY6G6FQ5SQ64 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LY6G6FQ5SQ64 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LY6G6FQ5SQ64 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LY6G6FQ5SQ64 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LY6G6FQ5SQ64 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LY6G6FQ5SQ64 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LY6G6FQ5SQ64 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LY6G6FQ5SQ64 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LY6G6FQ5SQ64 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LY6G6FQ5SQ64 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LY6G6FQ5SQ64 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LY6G6FQ5SQ64 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY6G6FQ5SQ64 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LY6G6FQ5SQ64 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LY6G6FQ5SQ64 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY6G6FQ5SQ64 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY6G6FQ5SQ64 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY6G6FQ5SQ64 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LY6G6FQ5SQ64 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LY6G6FQ5SQ64 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LY6G6FQ5SQ64 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LY6G6FQ5SQ64 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LY6G6FQ5SQ64 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LY6G6FQ5SQ64 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LY6G6FQ5SQ64 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LY6G6FQ5SQ64 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LY6G6FQ5SQ64 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LY6G6FQ5SQ64 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LY6G6FQ5SQ64 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LY6G6FQ5SQ64 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LY6G6FQ5SQ64 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LY6G6FQ5SQ64 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LY6G6FQ5SQ64 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LY6G6FQ5SQ64 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LY6G6FQ5SQ64 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LY6G6FQ5SQ64 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LY6G6FQ5SQ64 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LY6G6FQ5SQ64 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LY6G6FQ5SQ64 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LY6G6FQ5SQ64 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LY6G6FQ5SQ64 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LY6G6FQ5SQ64 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LY6G6FQ5SQ64 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LY6G6FQ5SQ64 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LY6G6FQ5SQ64 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LY6G6FQ5SQ64 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LY6G6FQ5SQ64 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LY6G6FQ5SQ64 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LY6G6FQ5SQ64 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LY6G6FQ5SQ64 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LY6G6FQ5SQ64 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LY6G6FQ5SQ64 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LY6G6FQ5SQ64 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LY6G6FQ5SQ64 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LY6G6FQ5SQ64 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LY6G6FQ5SQ64 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LY6G6FQ5SQ64 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LY6G6FQ5SQ64 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LY6G6FQ5SQ64 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LY6G6FQ5SQ64 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LY6G6FQ5SQ64 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LY6G6FQ5SQ64 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LY6G6FQ5SQ64 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LY6G6FQ5SQ64 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LY6G6FQ5SQ64 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LY6G6FQ5SQ64 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LY6G6FQ5SQ64 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LY6G6FQ5SQ64 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LY6G6FQ5SQ64 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LY6G6FQ5SQ64 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LY6G6FQ5SQ64 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY6G6FQ5SQ64 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LY6G6FQ5SQ64 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms