Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NHLRC3Q5JS37 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NHLRC3Q5JS37 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NHLRC3Q5JS37 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NHLRC3Q5JS37 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NHLRC3Q5JS37 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NHLRC3Q5JS37 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NHLRC3Q5JS37 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NHLRC3Q5JS37 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NHLRC3Q5JS37 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NHLRC3Q5JS37 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NHLRC3Q5JS37 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NHLRC3Q5JS37 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NHLRC3Q5JS37 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NHLRC3Q5JS37 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NHLRC3Q5JS37 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NHLRC3Q5JS37 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NHLRC3Q5JS37 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NHLRC3Q5JS37 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NHLRC3Q5JS37 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NHLRC3Q5JS37 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NHLRC3Q5JS37 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NHLRC3Q5JS37 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NHLRC3Q5JS37 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NHLRC3Q5JS37 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NHLRC3Q5JS37 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NHLRC3Q5JS37 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NHLRC3Q5JS37 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NHLRC3Q5JS37 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NHLRC3Q5JS37 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NHLRC3Q5JS37 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NHLRC3Q5JS37 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NHLRC3Q5JS37 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NHLRC3Q5JS37 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NHLRC3Q5JS37 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NHLRC3Q5JS37 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NHLRC3Q5JS37 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NHLRC3Q5JS37 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NHLRC3Q5JS37 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NHLRC3Q5JS37 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NHLRC3Q5JS37 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NHLRC3Q5JS37 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NHLRC3Q5JS37 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NHLRC3Q5JS37 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NHLRC3Q5JS37 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NHLRC3Q5JS37 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NHLRC3Q5JS37 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NHLRC3Q5JS37 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NHLRC3Q5JS37 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NHLRC3Q5JS37 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NHLRC3Q5JS37 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NHLRC3Q5JS37 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NHLRC3Q5JS37 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NHLRC3Q5JS37 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NHLRC3Q5JS37 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NHLRC3Q5JS37 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NHLRC3Q5JS37 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NHLRC3Q5JS37 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NHLRC3Q5JS37 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NHLRC3Q5JS37 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NHLRC3Q5JS37 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NHLRC3Q5JS37 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NHLRC3Q5JS37 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NHLRC3Q5JS37 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NHLRC3Q5JS37 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NHLRC3Q5JS37 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NHLRC3Q5JS37 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NHLRC3Q5JS37 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NHLRC3Q5JS37 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NHLRC3Q5JS37 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NHLRC3Q5JS37 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NHLRC3Q5JS37 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NHLRC3Q5JS37 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NHLRC3Q5JS37 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NHLRC3Q5JS37 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NHLRC3Q5JS37 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NHLRC3Q5JS37 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NHLRC3Q5JS37 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NHLRC3Q5JS37 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NHLRC3Q5JS37 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NHLRC3Q5JS37 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NHLRC3Q5JS37 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NHLRC3Q5JS37 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NHLRC3Q5JS37 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NHLRC3Q5JS37 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NHLRC3Q5JS37 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NHLRC3Q5JS37 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NHLRC3Q5JS37 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NHLRC3Q5JS37 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NHLRC3Q5JS37 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NHLRC3Q5JS37 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NHLRC3Q5JS37 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NHLRC3Q5JS37 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NHLRC3Q5JS37 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NHLRC3Q5JS37 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NHLRC3Q5JS37 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NHLRC3Q5JS37 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NHLRC3Q5JS37 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NHLRC3Q5JS37 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NHLRC3Q5JS37 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms