Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHT4

GSG1, Germ cell-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSG1Q2KHT4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSG1Q2KHT4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GSG1Q2KHT4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GSG1Q2KHT4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSG1Q2KHT4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GSG1Q2KHT4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSG1Q2KHT4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GSG1Q2KHT4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GSG1Q2KHT4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GSG1Q2KHT4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GSG1Q2KHT4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSG1Q2KHT4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSG1Q2KHT4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSG1Q2KHT4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSG1Q2KHT4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSG1Q2KHT4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSG1Q2KHT4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSG1Q2KHT4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GSG1Q2KHT4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GSG1Q2KHT4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GSG1Q2KHT4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GSG1Q2KHT4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GSG1Q2KHT4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GSG1Q2KHT4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSG1Q2KHT4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSG1Q2KHT4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSG1Q2KHT4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSG1Q2KHT4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSG1Q2KHT4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GSG1Q2KHT4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSG1Q2KHT4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GSG1Q2KHT4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSG1Q2KHT4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSG1Q2KHT4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GSG1Q2KHT4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GSG1Q2KHT4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GSG1Q2KHT4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GSG1Q2KHT4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GSG1Q2KHT4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GSG1Q2KHT4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSG1Q2KHT4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSG1Q2KHT4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSG1Q2KHT4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSG1Q2KHT4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSG1Q2KHT4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSG1Q2KHT4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSG1Q2KHT4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GSG1Q2KHT4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSG1Q2KHT4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GSG1Q2KHT4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSG1Q2KHT4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSG1Q2KHT4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSG1Q2KHT4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSG1Q2KHT4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSG1Q2KHT4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GSG1Q2KHT4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSG1Q2KHT4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSG1Q2KHT4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GSG1Q2KHT4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GSG1Q2KHT4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GSG1Q2KHT4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GSG1Q2KHT4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GSG1Q2KHT4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GSG1Q2KHT4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GSG1Q2KHT4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GSG1Q2KHT4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GSG1Q2KHT4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GSG1Q2KHT4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GSG1Q2KHT4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GSG1Q2KHT4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GSG1Q2KHT4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSG1Q2KHT4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSG1Q2KHT4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSG1Q2KHT4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSG1Q2KHT4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSG1Q2KHT4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSG1Q2KHT4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSG1Q2KHT4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GSG1Q2KHT4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GSG1Q2KHT4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GSG1Q2KHT4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GSG1Q2KHT4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GSG1Q2KHT4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GSG1Q2KHT4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GSG1Q2KHT4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GSG1Q2KHT4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GSG1Q2KHT4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSG1Q2KHT4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSG1Q2KHT4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSG1Q2KHT4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSG1Q2KHT4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSG1Q2KHT4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSG1Q2KHT4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSG1Q2KHT4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSG1Q2KHT4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSG1Q2KHT4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GSG1Q2KHT4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSG1Q2KHT4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSG1Q2KHT4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GSG1Q2KHT4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms