Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CSPP1Q1MSJ5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CSPP1Q1MSJ5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CSPP1Q1MSJ5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CSPP1Q1MSJ5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CSPP1Q1MSJ5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
CSPP1Q1MSJ5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CSPP1Q1MSJ5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CSPP1Q1MSJ5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CSPP1Q1MSJ5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CSPP1Q1MSJ5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CSPP1Q1MSJ5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CSPP1Q1MSJ5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CSPP1Q1MSJ5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CSPP1Q1MSJ5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CSPP1Q1MSJ5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CSPP1Q1MSJ5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CSPP1Q1MSJ5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CSPP1Q1MSJ5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CSPP1Q1MSJ5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CSPP1Q1MSJ5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CSPP1Q1MSJ5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CSPP1Q1MSJ5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CSPP1Q1MSJ5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CSPP1Q1MSJ5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CSPP1Q1MSJ5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CSPP1Q1MSJ5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CSPP1Q1MSJ5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CSPP1Q1MSJ5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CSPP1Q1MSJ5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CSPP1Q1MSJ5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CSPP1Q1MSJ5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CSPP1Q1MSJ5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CSPP1Q1MSJ5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CSPP1Q1MSJ5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
CSPP1Q1MSJ5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CSPP1Q1MSJ5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CSPP1Q1MSJ5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CSPP1Q1MSJ5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CSPP1Q1MSJ5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CSPP1Q1MSJ5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CSPP1Q1MSJ5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CSPP1Q1MSJ5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CSPP1Q1MSJ5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CSPP1Q1MSJ5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CSPP1Q1MSJ5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CSPP1Q1MSJ5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CSPP1Q1MSJ5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CSPP1Q1MSJ5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CSPP1Q1MSJ5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CSPP1Q1MSJ5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CSPP1Q1MSJ5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CSPP1Q1MSJ5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CSPP1Q1MSJ5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CSPP1Q1MSJ5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CSPP1Q1MSJ5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CSPP1Q1MSJ5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CSPP1Q1MSJ5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CSPP1Q1MSJ5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CSPP1Q1MSJ5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CSPP1Q1MSJ5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CSPP1Q1MSJ5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CSPP1Q1MSJ5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CSPP1Q1MSJ5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CSPP1Q1MSJ5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CSPP1Q1MSJ5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CSPP1Q1MSJ5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CSPP1Q1MSJ5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CSPP1Q1MSJ5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CSPP1Q1MSJ5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CSPP1Q1MSJ5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CSPP1Q1MSJ5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CSPP1Q1MSJ5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CSPP1Q1MSJ5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CSPP1Q1MSJ5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CSPP1Q1MSJ5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CSPP1Q1MSJ5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CSPP1Q1MSJ5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CSPP1Q1MSJ5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CSPP1Q1MSJ5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CSPP1Q1MSJ5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CSPP1Q1MSJ5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CSPP1Q1MSJ5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CSPP1Q1MSJ5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
CSPP1Q1MSJ5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CSPP1Q1MSJ5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CSPP1Q1MSJ5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CSPP1Q1MSJ5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CSPP1Q1MSJ5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CSPP1Q1MSJ5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CSPP1Q1MSJ5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CSPP1Q1MSJ5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CSPP1Q1MSJ5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CSPP1Q1MSJ5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CSPP1Q1MSJ5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms