Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNXAQ16473 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNXAQ16473 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNXAQ16473 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNXAQ16473 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNXAQ16473 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNXAQ16473 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNXAQ16473 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNXAQ16473 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TNXAQ16473 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNXAQ16473 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNXAQ16473 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TNXAQ16473 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNXAQ16473 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNXAQ16473 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNXAQ16473 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNXAQ16473 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNXAQ16473 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNXAQ16473 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNXAQ16473 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNXAQ16473 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNXAQ16473 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNXAQ16473 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNXAQ16473 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNXAQ16473 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNXAQ16473 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNXAQ16473 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNXAQ16473 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNXAQ16473 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNXAQ16473 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNXAQ16473 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNXAQ16473 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNXAQ16473 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNXAQ16473 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNXAQ16473 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNXAQ16473 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNXAQ16473 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNXAQ16473 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNXAQ16473 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNXAQ16473 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNXAQ16473 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNXAQ16473 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNXAQ16473 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNXAQ16473 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNXAQ16473 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNXAQ16473 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNXAQ16473 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNXAQ16473 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNXAQ16473 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNXAQ16473 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNXAQ16473 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TNXAQ16473 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNXAQ16473 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNXAQ16473 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TNXAQ16473 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNXAQ16473 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TNXAQ16473 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNXAQ16473 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNXAQ16473 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNXAQ16473 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNXAQ16473 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNXAQ16473 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNXAQ16473 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNXAQ16473 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNXAQ16473 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNXAQ16473 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TNXAQ16473 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNXAQ16473 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNXAQ16473 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TNXAQ16473 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNXAQ16473 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNXAQ16473 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNXAQ16473 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNXAQ16473 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNXAQ16473 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TNXAQ16473 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNXAQ16473 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNXAQ16473 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TNXAQ16473 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNXAQ16473 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNXAQ16473 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNXAQ16473 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNXAQ16473 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNXAQ16473 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNXAQ16473 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNXAQ16473 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNXAQ16473 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNXAQ16473 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNXAQ16473 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNXAQ16473 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNXAQ16473 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TNXAQ16473 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNXAQ16473 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNXAQ16473 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNXAQ16473 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNXAQ16473 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNXAQ16473 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNXAQ16473 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNXAQ16473 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNXAQ16473 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms