Protein–RNA interactions for Protein: Q13103

SPP2, Secreted phosphoprotein 24, humanhuman

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP2Q13103 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SPP2Q13103 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SPP2Q13103 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SPP2Q13103 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SPP2Q13103 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SPP2Q13103 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SPP2Q13103 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SPP2Q13103 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SPP2Q13103 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SPP2Q13103 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SPP2Q13103 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SPP2Q13103 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
SPP2Q13103 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SPP2Q13103 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
SPP2Q13103 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
SPP2Q13103 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
SPP2Q13103 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SPP2Q13103 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SPP2Q13103 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SPP2Q13103 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
SPP2Q13103 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
SPP2Q13103 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SPP2Q13103 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
SPP2Q13103 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
SPP2Q13103 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
SPP2Q13103 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SPP2Q13103 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SPP2Q13103 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SPP2Q13103 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SPP2Q13103 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SPP2Q13103 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SPP2Q13103 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SPP2Q13103 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SPP2Q13103 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
SPP2Q13103 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
SPP2Q13103 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SPP2Q13103 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SPP2Q13103 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SPP2Q13103 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SPP2Q13103 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SPP2Q13103 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SPP2Q13103 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SPP2Q13103 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SPP2Q13103 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SPP2Q13103 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SPP2Q13103 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SPP2Q13103 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SPP2Q13103 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SPP2Q13103 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SPP2Q13103 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SPP2Q13103 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SPP2Q13103 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
SPP2Q13103 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SPP2Q13103 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SPP2Q13103 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SPP2Q13103 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SPP2Q13103 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SPP2Q13103 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SPP2Q13103 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SPP2Q13103 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SPP2Q13103 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SPP2Q13103 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SPP2Q13103 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SPP2Q13103 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SPP2Q13103 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SPP2Q13103 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SPP2Q13103 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SPP2Q13103 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SPP2Q13103 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SPP2Q13103 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SPP2Q13103 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SPP2Q13103 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SPP2Q13103 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SPP2Q13103 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SPP2Q13103 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
SPP2Q13103 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SPP2Q13103 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SPP2Q13103 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SPP2Q13103 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SPP2Q13103 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SPP2Q13103 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SPP2Q13103 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SPP2Q13103 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SPP2Q13103 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SPP2Q13103 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SPP2Q13103 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SPP2Q13103 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SPP2Q13103 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
SPP2Q13103 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SPP2Q13103 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SPP2Q13103 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SPP2Q13103 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SPP2Q13103 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SPP2Q13103 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SPP2Q13103 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SPP2Q13103 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SPP2Q13103 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SPP2Q13103 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SPP2Q13103 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SPP2Q13103 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
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