Protein–RNA interactions for Protein: Q13103

SPP2, Secreted phosphoprotein 24, humanhuman

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP2Q13103 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.61■■■■■ 4.09
SPP2Q13103 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.94■■■■□ 3.98
SPP2Q13103 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SPP2Q13103 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
SPP2Q13103 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
SPP2Q13103 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
SPP2Q13103 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
SPP2Q13103 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
SPP2Q13103 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
SPP2Q13103 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
SPP2Q13103 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
SPP2Q13103 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
SPP2Q13103 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SPP2Q13103 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SPP2Q13103 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
SPP2Q13103 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
SPP2Q13103 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
SPP2Q13103 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SPP2Q13103 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SPP2Q13103 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
SPP2Q13103 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SPP2Q13103 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SPP2Q13103 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
SPP2Q13103 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
SPP2Q13103 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SPP2Q13103 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
SPP2Q13103 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
SPP2Q13103 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SPP2Q13103 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
SPP2Q13103 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
SPP2Q13103 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SPP2Q13103 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SPP2Q13103 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SPP2Q13103 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SPP2Q13103 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
SPP2Q13103 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
SPP2Q13103 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
SPP2Q13103 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SPP2Q13103 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SPP2Q13103 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SPP2Q13103 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SPP2Q13103 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SPP2Q13103 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SPP2Q13103 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SPP2Q13103 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SPP2Q13103 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SPP2Q13103 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SPP2Q13103 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SPP2Q13103 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SPP2Q13103 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SPP2Q13103 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
SPP2Q13103 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SPP2Q13103 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SPP2Q13103 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SPP2Q13103 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
SPP2Q13103 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SPP2Q13103 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
SPP2Q13103 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SPP2Q13103 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SPP2Q13103 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
SPP2Q13103 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SPP2Q13103 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SPP2Q13103 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
SPP2Q13103 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
SPP2Q13103 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SPP2Q13103 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SPP2Q13103 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
SPP2Q13103 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
SPP2Q13103 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
SPP2Q13103 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SPP2Q13103 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SPP2Q13103 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SPP2Q13103 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
SPP2Q13103 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
SPP2Q13103 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SPP2Q13103 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
SPP2Q13103 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
SPP2Q13103 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
SPP2Q13103 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SPP2Q13103 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
SPP2Q13103 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SPP2Q13103 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SPP2Q13103 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SPP2Q13103 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
SPP2Q13103 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SPP2Q13103 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
SPP2Q13103 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SPP2Q13103 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SPP2Q13103 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SPP2Q13103 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SPP2Q13103 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SPP2Q13103 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SPP2Q13103 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SPP2Q13103 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SPP2Q13103 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SPP2Q13103 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
SPP2Q13103 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SPP2Q13103 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SPP2Q13103 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SPP2Q13103 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
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