Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC16Q13042 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC16Q13042 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC16Q13042 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC16Q13042 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC16Q13042 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC16Q13042 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDC16Q13042 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDC16Q13042 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDC16Q13042 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDC16Q13042 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDC16Q13042 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDC16Q13042 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDC16Q13042 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDC16Q13042 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDC16Q13042 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDC16Q13042 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CDC16Q13042 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDC16Q13042 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDC16Q13042 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDC16Q13042 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDC16Q13042 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDC16Q13042 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDC16Q13042 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDC16Q13042 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC16Q13042 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDC16Q13042 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDC16Q13042 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC16Q13042 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDC16Q13042 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC16Q13042 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC16Q13042 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDC16Q13042 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC16Q13042 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC16Q13042 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDC16Q13042 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC16Q13042 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC16Q13042 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC16Q13042 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC16Q13042 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC16Q13042 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC16Q13042 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDC16Q13042 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC16Q13042 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC16Q13042 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDC16Q13042 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDC16Q13042 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC16Q13042 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC16Q13042 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC16Q13042 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC16Q13042 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC16Q13042 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CDC16Q13042 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC16Q13042 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CDC16Q13042 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC16Q13042 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CDC16Q13042 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC16Q13042 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC16Q13042 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CDC16Q13042 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC16Q13042 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDC16Q13042 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDC16Q13042 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDC16Q13042 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDC16Q13042 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDC16Q13042 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDC16Q13042 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDC16Q13042 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC16Q13042 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDC16Q13042 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC16Q13042 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC16Q13042 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC16Q13042 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC16Q13042 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDC16Q13042 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC16Q13042 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CDC16Q13042 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDC16Q13042 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDC16Q13042 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDC16Q13042 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDC16Q13042 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDC16Q13042 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDC16Q13042 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDC16Q13042 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDC16Q13042 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CDC16Q13042 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDC16Q13042 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC16Q13042 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC16Q13042 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC16Q13042 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC16Q13042 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC16Q13042 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC16Q13042 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC16Q13042 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC16Q13042 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDC16Q13042 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDC16Q13042 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDC16Q13042 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC16Q13042 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC16Q13042 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
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