Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
GOLGA3Q08378 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC44.76■■■■■ 4.76
GOLGA3Q08378 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC44.74■■■■■ 4.75
GOLGA3Q08378 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
GOLGA3Q08378 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
GOLGA3Q08378 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC44.71■■■■■ 4.75
GOLGA3Q08378 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC44.71■■■■■ 4.75
GOLGA3Q08378 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC44.7■■■■■ 4.75
GOLGA3Q08378 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC44.68■■■■■ 4.74
GOLGA3Q08378 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
GOLGA3Q08378 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC44.67■■■■■ 4.74
GOLGA3Q08378 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC44.65■■■■■ 4.74
GOLGA3Q08378 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
GOLGA3Q08378 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
GOLGA3Q08378 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
GOLGA3Q08378 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
GOLGA3Q08378 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC44.64■■■■■ 4.74
GOLGA3Q08378 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
GOLGA3Q08378 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC44.64■■■■■ 4.74
GOLGA3Q08378 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC44.63■■■■■ 4.73
GOLGA3Q08378 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC44.61■■■■■ 4.73
GOLGA3Q08378 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC44.61■■■■■ 4.73
GOLGA3Q08378 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
GOLGA3Q08378 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
GOLGA3Q08378 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
GOLGA3Q08378 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
GOLGA3Q08378 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
GOLGA3Q08378 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.56■■■■■ 4.72
GOLGA3Q08378 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
GOLGA3Q08378 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
GOLGA3Q08378 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
GOLGA3Q08378 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
GOLGA3Q08378 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC44.5■■■■■ 4.71
GOLGA3Q08378 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
GOLGA3Q08378 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
GOLGA3Q08378 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
GOLGA3Q08378 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
GOLGA3Q08378 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.44■■■■■ 4.7
GOLGA3Q08378 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
GOLGA3Q08378 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
GOLGA3Q08378 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.41■■■■■ 4.7
GOLGA3Q08378 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.4■■■■■ 4.7
GOLGA3Q08378 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
GOLGA3Q08378 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
GOLGA3Q08378 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
GOLGA3Q08378 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
GOLGA3Q08378 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC44.35■■■■■ 4.69
GOLGA3Q08378 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.69
GOLGA3Q08378 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.34■■■■■ 4.69
GOLGA3Q08378 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
GOLGA3Q08378 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
GOLGA3Q08378 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
GOLGA3Q08378 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
GOLGA3Q08378 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
GOLGA3Q08378 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
GOLGA3Q08378 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
GOLGA3Q08378 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC44.32■■■■■ 4.69
GOLGA3Q08378 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
GOLGA3Q08378 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
GOLGA3Q08378 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
GOLGA3Q08378 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC44.25■■■■■ 4.67
GOLGA3Q08378 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
GOLGA3Q08378 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
GOLGA3Q08378 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
GOLGA3Q08378 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
GOLGA3Q08378 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.23■■■■■ 4.67
GOLGA3Q08378 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC44.23■■■■■ 4.67
GOLGA3Q08378 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
GOLGA3Q08378 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC44.21■■■■■ 4.67
GOLGA3Q08378 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC44.21■■■■■ 4.67
GOLGA3Q08378 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC44.19■■■■■ 4.66
GOLGA3Q08378 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
GOLGA3Q08378 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
GOLGA3Q08378 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
GOLGA3Q08378 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC44.16■■■■■ 4.66
GOLGA3Q08378 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
GOLGA3Q08378 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
GOLGA3Q08378 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
GOLGA3Q08378 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
GOLGA3Q08378 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
GOLGA3Q08378 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
GOLGA3Q08378 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
GOLGA3Q08378 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC44.08■■■■■ 4.65
GOLGA3Q08378 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.07■■■■■ 4.65
GOLGA3Q08378 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
GOLGA3Q08378 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
GOLGA3Q08378 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC44.06■■■■■ 4.64
GOLGA3Q08378 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
GOLGA3Q08378 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
GOLGA3Q08378 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
GOLGA3Q08378 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC44.03■■■■■ 4.64
GOLGA3Q08378 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
GOLGA3Q08378 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
GOLGA3Q08378 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC44■■■■■ 4.63
GOLGA3Q08378 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC43.99■■■■■ 4.63
GOLGA3Q08378 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
GOLGA3Q08378 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
GOLGA3Q08378 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
GOLGA3Q08378 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
GOLGA3Q08378 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms