Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRSF11Q05519 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRSF11Q05519 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRSF11Q05519 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRSF11Q05519 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRSF11Q05519 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SRSF11Q05519 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRSF11Q05519 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRSF11Q05519 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRSF11Q05519 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRSF11Q05519 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRSF11Q05519 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRSF11Q05519 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SRSF11Q05519 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRSF11Q05519 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRSF11Q05519 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRSF11Q05519 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRSF11Q05519 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRSF11Q05519 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRSF11Q05519 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SRSF11Q05519 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRSF11Q05519 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRSF11Q05519 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRSF11Q05519 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRSF11Q05519 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRSF11Q05519 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SRSF11Q05519 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRSF11Q05519 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRSF11Q05519 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRSF11Q05519 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRSF11Q05519 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRSF11Q05519 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRSF11Q05519 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRSF11Q05519 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRSF11Q05519 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRSF11Q05519 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRSF11Q05519 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRSF11Q05519 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SRSF11Q05519 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRSF11Q05519 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRSF11Q05519 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRSF11Q05519 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRSF11Q05519 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRSF11Q05519 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRSF11Q05519 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRSF11Q05519 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRSF11Q05519 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRSF11Q05519 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRSF11Q05519 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRSF11Q05519 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRSF11Q05519 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRSF11Q05519 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SRSF11Q05519 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRSF11Q05519 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRSF11Q05519 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRSF11Q05519 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRSF11Q05519 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRSF11Q05519 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRSF11Q05519 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SRSF11Q05519 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRSF11Q05519 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRSF11Q05519 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRSF11Q05519 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRSF11Q05519 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRSF11Q05519 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRSF11Q05519 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRSF11Q05519 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRSF11Q05519 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRSF11Q05519 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRSF11Q05519 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRSF11Q05519 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRSF11Q05519 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRSF11Q05519 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SRSF11Q05519 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRSF11Q05519 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRSF11Q05519 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRSF11Q05519 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRSF11Q05519 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRSF11Q05519 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRSF11Q05519 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SRSF11Q05519 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRSF11Q05519 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SRSF11Q05519 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRSF11Q05519 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRSF11Q05519 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRSF11Q05519 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRSF11Q05519 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRSF11Q05519 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRSF11Q05519 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SRSF11Q05519 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRSF11Q05519 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SRSF11Q05519 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRSF11Q05519 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRSF11Q05519 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRSF11Q05519 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRSF11Q05519 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRSF11Q05519 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRSF11Q05519 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRSF11Q05519 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SRSF11Q05519 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms