Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE1BQ01064 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE1BQ01064 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PDE1BQ01064 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE1BQ01064 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDE1BQ01064 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE1BQ01064 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE1BQ01064 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDE1BQ01064 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE1BQ01064 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE1BQ01064 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE1BQ01064 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE1BQ01064 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE1BQ01064 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDE1BQ01064 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE1BQ01064 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDE1BQ01064 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE1BQ01064 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE1BQ01064 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDE1BQ01064 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE1BQ01064 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDE1BQ01064 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PDE1BQ01064 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE1BQ01064 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PDE1BQ01064 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE1BQ01064 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDE1BQ01064 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE1BQ01064 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE1BQ01064 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDE1BQ01064 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDE1BQ01064 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PDE1BQ01064 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE1BQ01064 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE1BQ01064 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDE1BQ01064 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDE1BQ01064 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDE1BQ01064 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDE1BQ01064 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE1BQ01064 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE1BQ01064 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE1BQ01064 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDE1BQ01064 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE1BQ01064 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE1BQ01064 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PDE1BQ01064 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDE1BQ01064 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDE1BQ01064 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE1BQ01064 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE1BQ01064 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE1BQ01064 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE1BQ01064 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE1BQ01064 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDE1BQ01064 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE1BQ01064 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE1BQ01064 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE1BQ01064 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE1BQ01064 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE1BQ01064 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE1BQ01064 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE1BQ01064 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE1BQ01064 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE1BQ01064 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE1BQ01064 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE1BQ01064 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE1BQ01064 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE1BQ01064 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDE1BQ01064 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE1BQ01064 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE1BQ01064 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE1BQ01064 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE1BQ01064 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE1BQ01064 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE1BQ01064 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE1BQ01064 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE1BQ01064 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE1BQ01064 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE1BQ01064 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE1BQ01064 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE1BQ01064 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE1BQ01064 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE1BQ01064 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE1BQ01064 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE1BQ01064 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE1BQ01064 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE1BQ01064 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE1BQ01064 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE1BQ01064 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE1BQ01064 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE1BQ01064 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE1BQ01064 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE1BQ01064 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE1BQ01064 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE1BQ01064 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE1BQ01064 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE1BQ01064 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE1BQ01064 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE1BQ01064 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PDE1BQ01064 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PDE1BQ01064 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE1BQ01064 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms