Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRX1P78414 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRX1P78414 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX1P78414 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IRX1P78414 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IRX1P78414 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IRX1P78414 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IRX1P78414 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IRX1P78414 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRX1P78414 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IRX1P78414 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
IRX1P78414 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IRX1P78414 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
IRX1P78414 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX1P78414 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX1P78414 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX1P78414 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IRX1P78414 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRX1P78414 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRX1P78414 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRX1P78414 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IRX1P78414 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRX1P78414 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
IRX1P78414 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IRX1P78414 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IRX1P78414 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX1P78414 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IRX1P78414 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IRX1P78414 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IRX1P78414 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
IRX1P78414 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IRX1P78414 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IRX1P78414 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IRX1P78414 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IRX1P78414 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRX1P78414 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRX1P78414 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IRX1P78414 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IRX1P78414 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
IRX1P78414 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
IRX1P78414 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRX1P78414 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IRX1P78414 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX1P78414 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX1P78414 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
IRX1P78414 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX1P78414 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IRX1P78414 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX1P78414 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX1P78414 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IRX1P78414 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX1P78414 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IRX1P78414 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX1P78414 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
IRX1P78414 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IRX1P78414 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IRX1P78414 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
IRX1P78414 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX1P78414 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IRX1P78414 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX1P78414 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX1P78414 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX1P78414 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IRX1P78414 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRX1P78414 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IRX1P78414 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRX1P78414 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRX1P78414 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRX1P78414 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX1P78414 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX1P78414 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX1P78414 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX1P78414 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX1P78414 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX1P78414 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX1P78414 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX1P78414 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX1P78414 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX1P78414 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX1P78414 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX1P78414 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX1P78414 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX1P78414 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX1P78414 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX1P78414 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRX1P78414 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IRX1P78414 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IRX1P78414 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRX1P78414 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRX1P78414 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRX1P78414 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRX1P78414 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRX1P78414 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRX1P78414 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX1P78414 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX1P78414 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IRX1P78414 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX1P78414 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IRX1P78414 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IRX1P78414 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms