Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CHMP4BP1P59074 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CHMP4BP1P59074 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CHMP4BP1P59074 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CHMP4BP1P59074 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHMP4BP1P59074 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHMP4BP1P59074 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHMP4BP1P59074 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHMP4BP1P59074 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHMP4BP1P59074 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHMP4BP1P59074 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHMP4BP1P59074 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHMP4BP1P59074 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHMP4BP1P59074 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHMP4BP1P59074 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CHMP4BP1P59074 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHMP4BP1P59074 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
CHMP4BP1P59074 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CHMP4BP1P59074 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CHMP4BP1P59074 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CHMP4BP1P59074 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CHMP4BP1P59074 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHMP4BP1P59074 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CHMP4BP1P59074 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHMP4BP1P59074 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CHMP4BP1P59074 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
CHMP4BP1P59074 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CHMP4BP1P59074 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CHMP4BP1P59074 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CHMP4BP1P59074 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CHMP4BP1P59074 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHMP4BP1P59074 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CHMP4BP1P59074 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CHMP4BP1P59074 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CHMP4BP1P59074 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CHMP4BP1P59074 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CHMP4BP1P59074 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CHMP4BP1P59074 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHMP4BP1P59074 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHMP4BP1P59074 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CHMP4BP1P59074 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHMP4BP1P59074 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHMP4BP1P59074 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHMP4BP1P59074 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CHMP4BP1P59074 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CHMP4BP1P59074 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CHMP4BP1P59074 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHMP4BP1P59074 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CHMP4BP1P59074 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHMP4BP1P59074 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHMP4BP1P59074 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHMP4BP1P59074 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHMP4BP1P59074 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CHMP4BP1P59074 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHMP4BP1P59074 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHMP4BP1P59074 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHMP4BP1P59074 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHMP4BP1P59074 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHMP4BP1P59074 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHMP4BP1P59074 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CHMP4BP1P59074 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CHMP4BP1P59074 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHMP4BP1P59074 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHMP4BP1P59074 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHMP4BP1P59074 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHMP4BP1P59074 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHMP4BP1P59074 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CHMP4BP1P59074 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CHMP4BP1P59074 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CHMP4BP1P59074 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CHMP4BP1P59074 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CHMP4BP1P59074 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHMP4BP1P59074 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHMP4BP1P59074 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHMP4BP1P59074 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CHMP4BP1P59074 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHMP4BP1P59074 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHMP4BP1P59074 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHMP4BP1P59074 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CHMP4BP1P59074 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHMP4BP1P59074 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHMP4BP1P59074 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CHMP4BP1P59074 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHMP4BP1P59074 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHMP4BP1P59074 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHMP4BP1P59074 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CHMP4BP1P59074 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CHMP4BP1P59074 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHMP4BP1P59074 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHMP4BP1P59074 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHMP4BP1P59074 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CHMP4BP1P59074 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHMP4BP1P59074 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHMP4BP1P59074 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHMP4BP1P59074 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CHMP4BP1P59074 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHMP4BP1P59074 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHMP4BP1P59074 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHMP4BP1P59074 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CHMP4BP1P59074 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms