Protein–RNA interactions for Protein: P57071

PRDM15, PR domain zinc finger protein 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM15P57071 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
PRDM15P57071 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
PRDM15P57071 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
PRDM15P57071 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
PRDM15P57071 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
PRDM15P57071 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
PRDM15P57071 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
PRDM15P57071 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
PRDM15P57071 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
PRDM15P57071 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
PRDM15P57071 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC40.61■■■■■ 4.09
PRDM15P57071 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC40.61■■■■■ 4.09
PRDM15P57071 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC40.61■■■■■ 4.09
PRDM15P57071 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC40.59■■■■■ 4.09
PRDM15P57071 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC40.59■■■■■ 4.09
PRDM15P57071 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
PRDM15P57071 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
PRDM15P57071 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
PRDM15P57071 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
PRDM15P57071 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
PRDM15P57071 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
PRDM15P57071 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
PRDM15P57071 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC40.54■■■■■ 4.08
PRDM15P57071 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
PRDM15P57071 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
PRDM15P57071 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
PRDM15P57071 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC40.51■■■■■ 4.08
PRDM15P57071 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
PRDM15P57071 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
PRDM15P57071 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
PRDM15P57071 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
PRDM15P57071 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC40.47■■■■■ 4.07
PRDM15P57071 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
PRDM15P57071 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
PRDM15P57071 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
PRDM15P57071 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
PRDM15P57071 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
PRDM15P57071 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
PRDM15P57071 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC40.42■■■■■ 4.06
PRDM15P57071 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC40.42■■■■■ 4.06
PRDM15P57071 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
PRDM15P57071 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
PRDM15P57071 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
PRDM15P57071 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
PRDM15P57071 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.06
PRDM15P57071 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC40.38■■■■■ 4.06
PRDM15P57071 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
PRDM15P57071 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
PRDM15P57071 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
PRDM15P57071 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
PRDM15P57071 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
PRDM15P57071 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
PRDM15P57071 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
PRDM15P57071 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
PRDM15P57071 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
PRDM15P57071 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
PRDM15P57071 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
PRDM15P57071 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
PRDM15P57071 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
PRDM15P57071 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
PRDM15P57071 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
PRDM15P57071 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
PRDM15P57071 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
PRDM15P57071 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
PRDM15P57071 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
PRDM15P57071 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
PRDM15P57071 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
PRDM15P57071 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
PRDM15P57071 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
PRDM15P57071 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PRDM15P57071 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
PRDM15P57071 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
PRDM15P57071 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
PRDM15P57071 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC40.17■■■■■ 4.02
PRDM15P57071 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
PRDM15P57071 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
PRDM15P57071 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
PRDM15P57071 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
PRDM15P57071 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
PRDM15P57071 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
PRDM15P57071 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
PRDM15P57071 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
PRDM15P57071 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
PRDM15P57071 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
PRDM15P57071 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
PRDM15P57071 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
PRDM15P57071 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
PRDM15P57071 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
PRDM15P57071 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
PRDM15P57071 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
PRDM15P57071 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
PRDM15P57071 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
PRDM15P57071 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
PRDM15P57071 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
PRDM15P57071 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.01■■■■■ 4
PRDM15P57071 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC40.01■■■■■ 4
PRDM15P57071 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
PRDM15P57071 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
PRDM15P57071 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
PRDM15P57071 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms