Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATXN3P54252 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATXN3P54252 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATXN3P54252 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ATXN3P54252 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ATXN3P54252 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATXN3P54252 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATXN3P54252 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATXN3P54252 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATXN3P54252 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATXN3P54252 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATXN3P54252 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATXN3P54252 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ATXN3P54252 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ATXN3P54252 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATXN3P54252 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ATXN3P54252 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATXN3P54252 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ATXN3P54252 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATXN3P54252 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATXN3P54252 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATXN3P54252 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATXN3P54252 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATXN3P54252 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATXN3P54252 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATXN3P54252 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATXN3P54252 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATXN3P54252 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATXN3P54252 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATXN3P54252 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATXN3P54252 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATXN3P54252 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATXN3P54252 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATXN3P54252 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ATXN3P54252 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATXN3P54252 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATXN3P54252 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATXN3P54252 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATXN3P54252 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATXN3P54252 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATXN3P54252 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATXN3P54252 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATXN3P54252 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATXN3P54252 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATXN3P54252 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATXN3P54252 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATXN3P54252 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATXN3P54252 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATXN3P54252 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATXN3P54252 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATXN3P54252 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATXN3P54252 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATXN3P54252 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATXN3P54252 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATXN3P54252 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATXN3P54252 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATXN3P54252 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATXN3P54252 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATXN3P54252 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATXN3P54252 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATXN3P54252 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATXN3P54252 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATXN3P54252 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATXN3P54252 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ATXN3P54252 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATXN3P54252 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATXN3P54252 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATXN3P54252 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATXN3P54252 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATXN3P54252 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATXN3P54252 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATXN3P54252 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATXN3P54252 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATXN3P54252 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATXN3P54252 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATXN3P54252 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATXN3P54252 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATXN3P54252 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATXN3P54252 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATXN3P54252 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATXN3P54252 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATXN3P54252 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATXN3P54252 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATXN3P54252 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATXN3P54252 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATXN3P54252 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATXN3P54252 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATXN3P54252 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATXN3P54252 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATXN3P54252 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATXN3P54252 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATXN3P54252 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATXN3P54252 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATXN3P54252 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATXN3P54252 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATXN3P54252 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATXN3P54252 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATXN3P54252 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATXN3P54252 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATXN3P54252 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms