Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NEK4P51957 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NEK4P51957 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NEK4P51957 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NEK4P51957 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NEK4P51957 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
NEK4P51957 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NEK4P51957 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NEK4P51957 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NEK4P51957 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
NEK4P51957 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
NEK4P51957 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NEK4P51957 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NEK4P51957 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NEK4P51957 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NEK4P51957 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NEK4P51957 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
NEK4P51957 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEK4P51957 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEK4P51957 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
NEK4P51957 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NEK4P51957 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NEK4P51957 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NEK4P51957 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
NEK4P51957 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NEK4P51957 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
NEK4P51957 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NEK4P51957 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NEK4P51957 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NEK4P51957 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NEK4P51957 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NEK4P51957 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NEK4P51957 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NEK4P51957 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NEK4P51957 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NEK4P51957 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NEK4P51957 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
NEK4P51957 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NEK4P51957 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEK4P51957 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
NEK4P51957 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEK4P51957 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEK4P51957 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEK4P51957 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEK4P51957 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEK4P51957 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEK4P51957 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEK4P51957 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEK4P51957 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEK4P51957 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEK4P51957 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEK4P51957 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEK4P51957 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEK4P51957 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NEK4P51957 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NEK4P51957 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NEK4P51957 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NEK4P51957 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NEK4P51957 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NEK4P51957 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NEK4P51957 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEK4P51957 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEK4P51957 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEK4P51957 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEK4P51957 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEK4P51957 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NEK4P51957 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NEK4P51957 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
NEK4P51957 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
NEK4P51957 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NEK4P51957 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NEK4P51957 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NEK4P51957 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
NEK4P51957 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NEK4P51957 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NEK4P51957 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NEK4P51957 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NEK4P51957 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
NEK4P51957 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
NEK4P51957 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NEK4P51957 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NEK4P51957 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NEK4P51957 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NEK4P51957 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NEK4P51957 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NEK4P51957 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NEK4P51957 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NEK4P51957 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NEK4P51957 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NEK4P51957 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NEK4P51957 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NEK4P51957 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NEK4P51957 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NEK4P51957 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NEK4P51957 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NEK4P51957 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NEK4P51957 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NEK4P51957 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NEK4P51957 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NEK4P51957 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms