Protein–RNA interactions for Protein: P50395

GDI2, Rab GDP dissociation inhibitor beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI2P50395 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GDI2P50395 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDI2P50395 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GDI2P50395 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDI2P50395 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDI2P50395 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDI2P50395 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GDI2P50395 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDI2P50395 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDI2P50395 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDI2P50395 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GDI2P50395 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDI2P50395 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDI2P50395 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GDI2P50395 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDI2P50395 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDI2P50395 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDI2P50395 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDI2P50395 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GDI2P50395 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDI2P50395 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDI2P50395 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GDI2P50395 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDI2P50395 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GDI2P50395 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GDI2P50395 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GDI2P50395 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDI2P50395 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GDI2P50395 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDI2P50395 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GDI2P50395 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDI2P50395 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDI2P50395 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GDI2P50395 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GDI2P50395 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDI2P50395 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDI2P50395 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDI2P50395 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GDI2P50395 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDI2P50395 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GDI2P50395 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GDI2P50395 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDI2P50395 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDI2P50395 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GDI2P50395 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDI2P50395 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GDI2P50395 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDI2P50395 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDI2P50395 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDI2P50395 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GDI2P50395 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDI2P50395 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDI2P50395 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDI2P50395 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDI2P50395 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GDI2P50395 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GDI2P50395 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDI2P50395 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDI2P50395 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GDI2P50395 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GDI2P50395 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GDI2P50395 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDI2P50395 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDI2P50395 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDI2P50395 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GDI2P50395 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDI2P50395 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GDI2P50395 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDI2P50395 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDI2P50395 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GDI2P50395 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GDI2P50395 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDI2P50395 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GDI2P50395 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GDI2P50395 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDI2P50395 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDI2P50395 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GDI2P50395 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GDI2P50395 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GDI2P50395 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GDI2P50395 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDI2P50395 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDI2P50395 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GDI2P50395 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GDI2P50395 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GDI2P50395 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GDI2P50395 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GDI2P50395 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GDI2P50395 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDI2P50395 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GDI2P50395 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GDI2P50395 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDI2P50395 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDI2P50395 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDI2P50395 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GDI2P50395 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDI2P50395 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDI2P50395 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDI2P50395 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDI2P50395 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms