Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IDH3AP50213 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IDH3AP50213 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IDH3AP50213 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IDH3AP50213 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IDH3AP50213 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IDH3AP50213 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IDH3AP50213 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IDH3AP50213 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IDH3AP50213 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IDH3AP50213 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IDH3AP50213 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IDH3AP50213 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IDH3AP50213 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IDH3AP50213 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IDH3AP50213 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IDH3AP50213 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IDH3AP50213 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IDH3AP50213 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IDH3AP50213 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IDH3AP50213 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IDH3AP50213 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IDH3AP50213 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IDH3AP50213 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IDH3AP50213 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IDH3AP50213 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
IDH3AP50213 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IDH3AP50213 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
IDH3AP50213 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
IDH3AP50213 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IDH3AP50213 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
IDH3AP50213 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IDH3AP50213 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IDH3AP50213 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IDH3AP50213 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
IDH3AP50213 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IDH3AP50213 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
IDH3AP50213 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IDH3AP50213 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IDH3AP50213 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
IDH3AP50213 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IDH3AP50213 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IDH3AP50213 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IDH3AP50213 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IDH3AP50213 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IDH3AP50213 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IDH3AP50213 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
IDH3AP50213 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IDH3AP50213 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IDH3AP50213 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IDH3AP50213 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IDH3AP50213 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IDH3AP50213 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
IDH3AP50213 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IDH3AP50213 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IDH3AP50213 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
IDH3AP50213 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
IDH3AP50213 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IDH3AP50213 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IDH3AP50213 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IDH3AP50213 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IDH3AP50213 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IDH3AP50213 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
IDH3AP50213 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IDH3AP50213 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
IDH3AP50213 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
IDH3AP50213 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IDH3AP50213 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IDH3AP50213 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IDH3AP50213 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IDH3AP50213 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
IDH3AP50213 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IDH3AP50213 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IDH3AP50213 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IDH3AP50213 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IDH3AP50213 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IDH3AP50213 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
IDH3AP50213 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IDH3AP50213 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IDH3AP50213 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IDH3AP50213 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IDH3AP50213 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IDH3AP50213 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
IDH3AP50213 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
IDH3AP50213 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
IDH3AP50213 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
IDH3AP50213 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IDH3AP50213 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IDH3AP50213 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IDH3AP50213 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IDH3AP50213 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IDH3AP50213 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IDH3AP50213 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IDH3AP50213 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IDH3AP50213 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IDH3AP50213 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IDH3AP50213 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IDH3AP50213 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IDH3AP50213 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IDH3AP50213 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms