Protein–RNA interactions for Protein: P47914

RPL29, 60S ribosomal protein L29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL29P47914 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL29P47914 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPL29P47914 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL29P47914 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL29P47914 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL29P47914 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL29P47914 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL29P47914 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL29P47914 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL29P47914 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL29P47914 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL29P47914 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL29P47914 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL29P47914 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL29P47914 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL29P47914 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL29P47914 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL29P47914 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL29P47914 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL29P47914 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPL29P47914 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL29P47914 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPL29P47914 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPL29P47914 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPL29P47914 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL29P47914 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPL29P47914 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPL29P47914 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL29P47914 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL29P47914 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPL29P47914 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL29P47914 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RPL29P47914 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPL29P47914 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL29P47914 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL29P47914 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPL29P47914 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPL29P47914 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RPL29P47914 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL29P47914 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RPL29P47914 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPL29P47914 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL29P47914 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL29P47914 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL29P47914 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL29P47914 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPL29P47914 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL29P47914 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPL29P47914 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL29P47914 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL29P47914 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL29P47914 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL29P47914 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL29P47914 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL29P47914 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL29P47914 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL29P47914 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL29P47914 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL29P47914 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL29P47914 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL29P47914 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL29P47914 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL29P47914 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL29P47914 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL29P47914 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL29P47914 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL29P47914 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL29P47914 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPL29P47914 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPL29P47914 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPL29P47914 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL29P47914 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL29P47914 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL29P47914 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL29P47914 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL29P47914 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL29P47914 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL29P47914 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL29P47914 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL29P47914 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL29P47914 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPL29P47914 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RPL29P47914 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL29P47914 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL29P47914 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPL29P47914 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL29P47914 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL29P47914 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL29P47914 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPL29P47914 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL29P47914 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL29P47914 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPL29P47914 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL29P47914 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPL29P47914 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL29P47914 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL29P47914 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL29P47914 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPL29P47914 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPL29P47914 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms