Protein–RNA interactions for Protein: P30926

CHRNB4, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB4P30926 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNB4P30926 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNB4P30926 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRNB4P30926 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNB4P30926 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNB4P30926 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNB4P30926 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNB4P30926 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNB4P30926 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNB4P30926 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNB4P30926 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNB4P30926 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNB4P30926 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNB4P30926 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNB4P30926 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNB4P30926 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNB4P30926 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNB4P30926 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNB4P30926 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHRNB4P30926 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNB4P30926 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNB4P30926 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNB4P30926 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNB4P30926 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNB4P30926 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNB4P30926 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNB4P30926 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNB4P30926 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNB4P30926 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNB4P30926 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNB4P30926 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNB4P30926 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNB4P30926 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNB4P30926 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNB4P30926 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNB4P30926 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNB4P30926 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNB4P30926 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNB4P30926 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNB4P30926 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNB4P30926 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNB4P30926 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNB4P30926 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNB4P30926 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNB4P30926 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNB4P30926 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNB4P30926 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNB4P30926 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNB4P30926 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNB4P30926 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNB4P30926 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNB4P30926 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHRNB4P30926 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHRNB4P30926 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNB4P30926 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNB4P30926 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNB4P30926 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNB4P30926 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNB4P30926 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNB4P30926 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNB4P30926 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNB4P30926 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNB4P30926 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNB4P30926 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNB4P30926 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNB4P30926 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNB4P30926 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNB4P30926 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNB4P30926 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNB4P30926 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHRNB4P30926 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHRNB4P30926 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNB4P30926 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNB4P30926 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNB4P30926 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNB4P30926 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNB4P30926 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNB4P30926 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNB4P30926 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHRNB4P30926 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNB4P30926 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNB4P30926 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHRNB4P30926 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNB4P30926 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNB4P30926 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHRNB4P30926 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHRNB4P30926 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHRNB4P30926 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNB4P30926 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHRNB4P30926 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNB4P30926 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNB4P30926 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNB4P30926 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNB4P30926 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNB4P30926 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNB4P30926 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNB4P30926 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNB4P30926 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNB4P30926 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNB4P30926 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms