Protein–RNA interactions for Protein: P30926

CHRNB4, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB4P30926 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHRNB4P30926 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHRNB4P30926 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHRNB4P30926 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHRNB4P30926 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CHRNB4P30926 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHRNB4P30926 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CHRNB4P30926 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CHRNB4P30926 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHRNB4P30926 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHRNB4P30926 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHRNB4P30926 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHRNB4P30926 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHRNB4P30926 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CHRNB4P30926 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CHRNB4P30926 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CHRNB4P30926 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHRNB4P30926 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHRNB4P30926 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHRNB4P30926 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHRNB4P30926 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRNB4P30926 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CHRNB4P30926 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CHRNB4P30926 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CHRNB4P30926 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CHRNB4P30926 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRNB4P30926 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRNB4P30926 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRNB4P30926 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRNB4P30926 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRNB4P30926 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNB4P30926 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CHRNB4P30926 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRNB4P30926 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNB4P30926 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNB4P30926 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNB4P30926 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNB4P30926 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHRNB4P30926 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNB4P30926 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHRNB4P30926 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNB4P30926 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNB4P30926 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNB4P30926 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHRNB4P30926 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CHRNB4P30926 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHRNB4P30926 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHRNB4P30926 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHRNB4P30926 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHRNB4P30926 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHRNB4P30926 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNB4P30926 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNB4P30926 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHRNB4P30926 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CHRNB4P30926 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CHRNB4P30926 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CHRNB4P30926 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CHRNB4P30926 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CHRNB4P30926 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNB4P30926 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHRNB4P30926 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNB4P30926 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHRNB4P30926 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHRNB4P30926 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNB4P30926 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNB4P30926 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNB4P30926 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRNB4P30926 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRNB4P30926 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHRNB4P30926 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHRNB4P30926 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHRNB4P30926 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRNB4P30926 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHRNB4P30926 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CHRNB4P30926 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHRNB4P30926 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRNB4P30926 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHRNB4P30926 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHRNB4P30926 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNB4P30926 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHRNB4P30926 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNB4P30926 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNB4P30926 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNB4P30926 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNB4P30926 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNB4P30926 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CHRNB4P30926 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNB4P30926 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNB4P30926 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNB4P30926 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNB4P30926 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNB4P30926 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNB4P30926 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNB4P30926 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNB4P30926 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNB4P30926 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNB4P30926 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNB4P30926 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNB4P30926 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNB4P30926 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms