Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP5DP30049 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP5DP30049 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP5DP30049 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP5DP30049 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP5DP30049 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP5DP30049 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP5DP30049 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP5DP30049 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP5DP30049 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP5DP30049 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP5DP30049 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP5DP30049 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP5DP30049 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP5DP30049 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP5DP30049 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP5DP30049 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP5DP30049 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP5DP30049 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP5DP30049 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP5DP30049 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP5DP30049 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP5DP30049 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP5DP30049 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP5DP30049 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP5DP30049 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP5DP30049 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP5DP30049 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP5DP30049 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP5DP30049 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP5DP30049 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP5DP30049 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP5DP30049 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP5DP30049 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP5DP30049 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP5DP30049 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP5DP30049 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP5DP30049 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP5DP30049 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP5DP30049 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP5DP30049 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP5DP30049 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP5DP30049 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP5DP30049 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP5DP30049 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP5DP30049 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP5DP30049 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP5DP30049 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP5DP30049 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP5DP30049 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATP5DP30049 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATP5DP30049 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP5DP30049 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ATP5DP30049 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP5DP30049 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP5DP30049 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP5DP30049 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATP5DP30049 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP5DP30049 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP5DP30049 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP5DP30049 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP5DP30049 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP5DP30049 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP5DP30049 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP5DP30049 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP5DP30049 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP5DP30049 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP5DP30049 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP5DP30049 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP5DP30049 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP5DP30049 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP5DP30049 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP5DP30049 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP5DP30049 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP5DP30049 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP5DP30049 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP5DP30049 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP5DP30049 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP5DP30049 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP5DP30049 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP5DP30049 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP5DP30049 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP5DP30049 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP5DP30049 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP5DP30049 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP5DP30049 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP5DP30049 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP5DP30049 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP5DP30049 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP5DP30049 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATP5DP30049 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP5DP30049 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP5DP30049 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP5DP30049 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP5DP30049 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP5DP30049 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP5DP30049 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP5DP30049 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP5DP30049 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP5DP30049 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms