Protein–RNA interactions for Protein: P27695

APEX1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX1P27695 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APEX1P27695 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APEX1P27695 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
APEX1P27695 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
APEX1P27695 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
APEX1P27695 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APEX1P27695 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APEX1P27695 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APEX1P27695 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APEX1P27695 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APEX1P27695 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APEX1P27695 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APEX1P27695 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APEX1P27695 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APEX1P27695 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APEX1P27695 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APEX1P27695 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APEX1P27695 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
APEX1P27695 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APEX1P27695 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APEX1P27695 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APEX1P27695 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APEX1P27695 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APEX1P27695 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APEX1P27695 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APEX1P27695 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APEX1P27695 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APEX1P27695 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APEX1P27695 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APEX1P27695 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APEX1P27695 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APEX1P27695 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APEX1P27695 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APEX1P27695 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APEX1P27695 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APEX1P27695 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APEX1P27695 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APEX1P27695 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APEX1P27695 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APEX1P27695 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APEX1P27695 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APEX1P27695 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APEX1P27695 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APEX1P27695 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APEX1P27695 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APEX1P27695 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
APEX1P27695 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
APEX1P27695 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
APEX1P27695 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
APEX1P27695 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APEX1P27695 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APEX1P27695 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APEX1P27695 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APEX1P27695 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APEX1P27695 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APEX1P27695 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APEX1P27695 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APEX1P27695 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
APEX1P27695 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APEX1P27695 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
APEX1P27695 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
APEX1P27695 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APEX1P27695 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
APEX1P27695 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
APEX1P27695 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
APEX1P27695 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
APEX1P27695 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
APEX1P27695 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
APEX1P27695 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APEX1P27695 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
APEX1P27695 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
APEX1P27695 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APEX1P27695 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APEX1P27695 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APEX1P27695 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APEX1P27695 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APEX1P27695 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APEX1P27695 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APEX1P27695 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APEX1P27695 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APEX1P27695 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APEX1P27695 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APEX1P27695 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APEX1P27695 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APEX1P27695 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APEX1P27695 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APEX1P27695 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APEX1P27695 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APEX1P27695 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APEX1P27695 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APEX1P27695 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APEX1P27695 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APEX1P27695 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APEX1P27695 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APEX1P27695 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APEX1P27695 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APEX1P27695 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APEX1P27695 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APEX1P27695 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APEX1P27695 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms