Protein–RNA interactions for Protein: P08621

SNRNP70, U1 small nuclear ribonucleoprotein 70 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP70P08621 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRNP70P08621 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP70P08621 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP70P08621 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRNP70P08621 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP70P08621 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP70P08621 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP70P08621 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP70P08621 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRNP70P08621 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRNP70P08621 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRNP70P08621 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRNP70P08621 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP70P08621 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP70P08621 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP70P08621 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRNP70P08621 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP70P08621 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRNP70P08621 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP70P08621 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP70P08621 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP70P08621 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRNP70P08621 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRNP70P08621 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRNP70P08621 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP70P08621 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP70P08621 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP70P08621 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRNP70P08621 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP70P08621 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP70P08621 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRNP70P08621 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRNP70P08621 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRNP70P08621 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP70P08621 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP70P08621 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRNP70P08621 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP70P08621 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP70P08621 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRNP70P08621 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP70P08621 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP70P08621 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP70P08621 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP70P08621 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP70P08621 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRNP70P08621 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP70P08621 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRNP70P08621 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRNP70P08621 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRNP70P08621 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP70P08621 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP70P08621 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRNP70P08621 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP70P08621 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP70P08621 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNRNP70P08621 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP70P08621 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP70P08621 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP70P08621 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP70P08621 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP70P08621 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP70P08621 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP70P08621 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP70P08621 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP70P08621 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP70P08621 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP70P08621 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP70P08621 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP70P08621 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP70P08621 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP70P08621 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP70P08621 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP70P08621 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP70P08621 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP70P08621 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP70P08621 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP70P08621 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP70P08621 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP70P08621 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP70P08621 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP70P08621 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP70P08621 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP70P08621 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP70P08621 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP70P08621 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRNP70P08621 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRNP70P08621 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRNP70P08621 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRNP70P08621 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRNP70P08621 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRNP70P08621 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRNP70P08621 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRNP70P08621 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRNP70P08621 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRNP70P08621 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRNP70P08621 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRNP70P08621 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRNP70P08621 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRNP70P08621 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRNP70P08621 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms