Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TUBB4AP04350 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TUBB4AP04350 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TUBB4AP04350 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TUBB4AP04350 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TUBB4AP04350 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TUBB4AP04350 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TUBB4AP04350 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TUBB4AP04350 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TUBB4AP04350 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TUBB4AP04350 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TUBB4AP04350 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TUBB4AP04350 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TUBB4AP04350 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TUBB4AP04350 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TUBB4AP04350 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TUBB4AP04350 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TUBB4AP04350 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TUBB4AP04350 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TUBB4AP04350 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TUBB4AP04350 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TUBB4AP04350 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TUBB4AP04350 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TUBB4AP04350 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TUBB4AP04350 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TUBB4AP04350 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TUBB4AP04350 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TUBB4AP04350 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TUBB4AP04350 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TUBB4AP04350 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TUBB4AP04350 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TUBB4AP04350 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TUBB4AP04350 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TUBB4AP04350 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TUBB4AP04350 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TUBB4AP04350 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TUBB4AP04350 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TUBB4AP04350 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TUBB4AP04350 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TUBB4AP04350 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TUBB4AP04350 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TUBB4AP04350 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TUBB4AP04350 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TUBB4AP04350 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TUBB4AP04350 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TUBB4AP04350 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TUBB4AP04350 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TUBB4AP04350 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TUBB4AP04350 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TUBB4AP04350 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TUBB4AP04350 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TUBB4AP04350 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TUBB4AP04350 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TUBB4AP04350 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TUBB4AP04350 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TUBB4AP04350 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TUBB4AP04350 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TUBB4AP04350 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TUBB4AP04350 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TUBB4AP04350 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TUBB4AP04350 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TUBB4AP04350 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TUBB4AP04350 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TUBB4AP04350 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TUBB4AP04350 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TUBB4AP04350 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TUBB4AP04350 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TUBB4AP04350 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TUBB4AP04350 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TUBB4AP04350 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TUBB4AP04350 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TUBB4AP04350 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TUBB4AP04350 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TUBB4AP04350 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TUBB4AP04350 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TUBB4AP04350 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TUBB4AP04350 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TUBB4AP04350 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TUBB4AP04350 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TUBB4AP04350 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TUBB4AP04350 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TUBB4AP04350 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TUBB4AP04350 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TUBB4AP04350 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TUBB4AP04350 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TUBB4AP04350 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TUBB4AP04350 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TUBB4AP04350 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TUBB4AP04350 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TUBB4AP04350 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TUBB4AP04350 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TUBB4AP04350 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TUBB4AP04350 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TUBB4AP04350 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TUBB4AP04350 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TUBB4AP04350 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TUBB4AP04350 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TUBB4AP04350 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TUBB4AP04350 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TUBB4AP04350 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms