Protein–RNA interactions for Protein: P00403

MT-CO2, Cytochrome c oxidase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-CO2P00403 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MT-CO2P00403 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MT-CO2P00403 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MT-CO2P00403 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MT-CO2P00403 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MT-CO2P00403 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MT-CO2P00403 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MT-CO2P00403 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MT-CO2P00403 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MT-CO2P00403 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MT-CO2P00403 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MT-CO2P00403 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MT-CO2P00403 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MT-CO2P00403 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MT-CO2P00403 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MT-CO2P00403 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MT-CO2P00403 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MT-CO2P00403 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MT-CO2P00403 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MT-CO2P00403 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MT-CO2P00403 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MT-CO2P00403 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MT-CO2P00403 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MT-CO2P00403 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MT-CO2P00403 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MT-CO2P00403 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MT-CO2P00403 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MT-CO2P00403 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MT-CO2P00403 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MT-CO2P00403 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MT-CO2P00403 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MT-CO2P00403 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MT-CO2P00403 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MT-CO2P00403 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MT-CO2P00403 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MT-CO2P00403 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MT-CO2P00403 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MT-CO2P00403 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MT-CO2P00403 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MT-CO2P00403 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MT-CO2P00403 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MT-CO2P00403 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MT-CO2P00403 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MT-CO2P00403 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MT-CO2P00403 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MT-CO2P00403 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MT-CO2P00403 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MT-CO2P00403 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MT-CO2P00403 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MT-CO2P00403 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MT-CO2P00403 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MT-CO2P00403 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MT-CO2P00403 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MT-CO2P00403 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MT-CO2P00403 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MT-CO2P00403 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MT-CO2P00403 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MT-CO2P00403 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MT-CO2P00403 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MT-CO2P00403 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MT-CO2P00403 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MT-CO2P00403 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MT-CO2P00403 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MT-CO2P00403 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MT-CO2P00403 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MT-CO2P00403 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MT-CO2P00403 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MT-CO2P00403 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MT-CO2P00403 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MT-CO2P00403 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MT-CO2P00403 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MT-CO2P00403 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MT-CO2P00403 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MT-CO2P00403 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MT-CO2P00403 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MT-CO2P00403 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MT-CO2P00403 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MT-CO2P00403 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MT-CO2P00403 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MT-CO2P00403 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MT-CO2P00403 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MT-CO2P00403 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MT-CO2P00403 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MT-CO2P00403 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MT-CO2P00403 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MT-CO2P00403 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MT-CO2P00403 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MT-CO2P00403 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MT-CO2P00403 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MT-CO2P00403 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MT-CO2P00403 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MT-CO2P00403 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MT-CO2P00403 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MT-CO2P00403 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MT-CO2P00403 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MT-CO2P00403 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MT-CO2P00403 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MT-CO2P00403 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MT-CO2P00403 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MT-CO2P00403 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms