Protein–RNA interactions for Protein: O95157

NXPH3, Neurexophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPH3O95157 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXPH3O95157 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NXPH3O95157 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXPH3O95157 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NXPH3O95157 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NXPH3O95157 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NXPH3O95157 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NXPH3O95157 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NXPH3O95157 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXPH3O95157 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXPH3O95157 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NXPH3O95157 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXPH3O95157 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXPH3O95157 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NXPH3O95157 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NXPH3O95157 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXPH3O95157 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NXPH3O95157 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NXPH3O95157 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NXPH3O95157 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXPH3O95157 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NXPH3O95157 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXPH3O95157 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NXPH3O95157 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NXPH3O95157 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPH3O95157 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NXPH3O95157 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXPH3O95157 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXPH3O95157 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NXPH3O95157 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NXPH3O95157 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NXPH3O95157 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NXPH3O95157 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NXPH3O95157 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NXPH3O95157 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXPH3O95157 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NXPH3O95157 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NXPH3O95157 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NXPH3O95157 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXPH3O95157 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXPH3O95157 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NXPH3O95157 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXPH3O95157 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXPH3O95157 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NXPH3O95157 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXPH3O95157 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXPH3O95157 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NXPH3O95157 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXPH3O95157 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NXPH3O95157 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NXPH3O95157 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NXPH3O95157 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NXPH3O95157 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NXPH3O95157 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXPH3O95157 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXPH3O95157 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NXPH3O95157 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXPH3O95157 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXPH3O95157 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXPH3O95157 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NXPH3O95157 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXPH3O95157 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXPH3O95157 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NXPH3O95157 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXPH3O95157 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXPH3O95157 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXPH3O95157 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NXPH3O95157 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXPH3O95157 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NXPH3O95157 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXPH3O95157 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXPH3O95157 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXPH3O95157 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NXPH3O95157 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NXPH3O95157 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NXPH3O95157 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NXPH3O95157 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXPH3O95157 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXPH3O95157 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXPH3O95157 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NXPH3O95157 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NXPH3O95157 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXPH3O95157 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NXPH3O95157 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NXPH3O95157 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXPH3O95157 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NXPH3O95157 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NXPH3O95157 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NXPH3O95157 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NXPH3O95157 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NXPH3O95157 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NXPH3O95157 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NXPH3O95157 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NXPH3O95157 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXPH3O95157 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXPH3O95157 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXPH3O95157 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXPH3O95157 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXPH3O95157 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NXPH3O95157 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms