Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SKAP2O75563 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SKAP2O75563 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKAP2O75563 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKAP2O75563 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKAP2O75563 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKAP2O75563 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SKAP2O75563 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SKAP2O75563 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SKAP2O75563 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SKAP2O75563 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SKAP2O75563 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SKAP2O75563 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SKAP2O75563 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SKAP2O75563 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SKAP2O75563 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SKAP2O75563 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SKAP2O75563 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SKAP2O75563 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SKAP2O75563 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SKAP2O75563 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SKAP2O75563 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SKAP2O75563 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SKAP2O75563 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SKAP2O75563 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SKAP2O75563 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SKAP2O75563 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SKAP2O75563 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SKAP2O75563 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SKAP2O75563 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SKAP2O75563 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SKAP2O75563 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SKAP2O75563 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SKAP2O75563 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SKAP2O75563 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SKAP2O75563 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SKAP2O75563 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SKAP2O75563 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SKAP2O75563 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SKAP2O75563 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKAP2O75563 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKAP2O75563 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKAP2O75563 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SKAP2O75563 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKAP2O75563 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKAP2O75563 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKAP2O75563 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKAP2O75563 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKAP2O75563 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SKAP2O75563 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SKAP2O75563 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SKAP2O75563 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SKAP2O75563 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SKAP2O75563 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SKAP2O75563 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SKAP2O75563 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKAP2O75563 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKAP2O75563 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SKAP2O75563 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKAP2O75563 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SKAP2O75563 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SKAP2O75563 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKAP2O75563 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKAP2O75563 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKAP2O75563 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKAP2O75563 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SKAP2O75563 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SKAP2O75563 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKAP2O75563 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKAP2O75563 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKAP2O75563 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SKAP2O75563 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SKAP2O75563 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SKAP2O75563 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SKAP2O75563 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SKAP2O75563 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SKAP2O75563 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKAP2O75563 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKAP2O75563 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKAP2O75563 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKAP2O75563 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKAP2O75563 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SKAP2O75563 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKAP2O75563 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKAP2O75563 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKAP2O75563 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKAP2O75563 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKAP2O75563 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKAP2O75563 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKAP2O75563 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKAP2O75563 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKAP2O75563 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKAP2O75563 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SKAP2O75563 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SKAP2O75563 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SKAP2O75563 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SKAP2O75563 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SKAP2O75563 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKAP2O75563 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SKAP2O75563 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms