Protein–RNA interactions for Protein: O75449

KATNA1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNA1O75449 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KATNA1O75449 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KATNA1O75449 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KATNA1O75449 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KATNA1O75449 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KATNA1O75449 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KATNA1O75449 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KATNA1O75449 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KATNA1O75449 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KATNA1O75449 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KATNA1O75449 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KATNA1O75449 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KATNA1O75449 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KATNA1O75449 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KATNA1O75449 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KATNA1O75449 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KATNA1O75449 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KATNA1O75449 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KATNA1O75449 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KATNA1O75449 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KATNA1O75449 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KATNA1O75449 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KATNA1O75449 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KATNA1O75449 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KATNA1O75449 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KATNA1O75449 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KATNA1O75449 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KATNA1O75449 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KATNA1O75449 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KATNA1O75449 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KATNA1O75449 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KATNA1O75449 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KATNA1O75449 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KATNA1O75449 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KATNA1O75449 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KATNA1O75449 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KATNA1O75449 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KATNA1O75449 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KATNA1O75449 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KATNA1O75449 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KATNA1O75449 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KATNA1O75449 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KATNA1O75449 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KATNA1O75449 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KATNA1O75449 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KATNA1O75449 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KATNA1O75449 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KATNA1O75449 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KATNA1O75449 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KATNA1O75449 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KATNA1O75449 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KATNA1O75449 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KATNA1O75449 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KATNA1O75449 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KATNA1O75449 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KATNA1O75449 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KATNA1O75449 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KATNA1O75449 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KATNA1O75449 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KATNA1O75449 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
KATNA1O75449 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KATNA1O75449 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KATNA1O75449 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KATNA1O75449 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KATNA1O75449 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KATNA1O75449 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KATNA1O75449 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
KATNA1O75449 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KATNA1O75449 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KATNA1O75449 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KATNA1O75449 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
KATNA1O75449 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KATNA1O75449 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
KATNA1O75449 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KATNA1O75449 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KATNA1O75449 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KATNA1O75449 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KATNA1O75449 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KATNA1O75449 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KATNA1O75449 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KATNA1O75449 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KATNA1O75449 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KATNA1O75449 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
KATNA1O75449 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KATNA1O75449 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KATNA1O75449 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KATNA1O75449 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KATNA1O75449 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KATNA1O75449 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KATNA1O75449 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KATNA1O75449 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KATNA1O75449 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KATNA1O75449 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KATNA1O75449 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KATNA1O75449 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KATNA1O75449 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KATNA1O75449 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KATNA1O75449 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KATNA1O75449 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KATNA1O75449 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms