Protein–RNA interactions for Protein: O60941

DTNB, Dystrobrevin beta, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTNBO60941 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.7
DTNBO60941 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
DTNBO60941 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
DTNBO60941 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
DTNBO60941 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
DTNBO60941 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
DTNBO60941 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
DTNBO60941 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
DTNBO60941 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
DTNBO60941 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
DTNBO60941 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
DTNBO60941 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
DTNBO60941 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
DTNBO60941 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
DTNBO60941 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
DTNBO60941 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
DTNBO60941 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
DTNBO60941 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
DTNBO60941 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
DTNBO60941 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
DTNBO60941 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
DTNBO60941 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
DTNBO60941 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
DTNBO60941 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
DTNBO60941 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
DTNBO60941 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
DTNBO60941 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
DTNBO60941 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
DTNBO60941 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
DTNBO60941 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
DTNBO60941 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
DTNBO60941 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
DTNBO60941 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
DTNBO60941 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
DTNBO60941 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
DTNBO60941 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
DTNBO60941 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
DTNBO60941 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
DTNBO60941 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
DTNBO60941 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
DTNBO60941 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
DTNBO60941 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
DTNBO60941 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
DTNBO60941 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
DTNBO60941 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
DTNBO60941 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
DTNBO60941 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
DTNBO60941 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
DTNBO60941 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
DTNBO60941 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
DTNBO60941 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
DTNBO60941 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
DTNBO60941 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
DTNBO60941 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
DTNBO60941 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
DTNBO60941 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
DTNBO60941 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
DTNBO60941 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
DTNBO60941 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
DTNBO60941 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
DTNBO60941 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
DTNBO60941 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
DTNBO60941 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
DTNBO60941 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
DTNBO60941 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
DTNBO60941 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
DTNBO60941 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
DTNBO60941 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
DTNBO60941 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
DTNBO60941 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
DTNBO60941 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
DTNBO60941 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
DTNBO60941 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
DTNBO60941 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
DTNBO60941 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
DTNBO60941 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
DTNBO60941 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
DTNBO60941 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
DTNBO60941 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
DTNBO60941 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
DTNBO60941 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
DTNBO60941 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.37■■■□□ 2.61
DTNBO60941 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
DTNBO60941 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
DTNBO60941 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
DTNBO60941 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
DTNBO60941 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
DTNBO60941 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
DTNBO60941 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
DTNBO60941 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
DTNBO60941 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
DTNBO60941 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
DTNBO60941 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
DTNBO60941 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
DTNBO60941 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
DTNBO60941 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
DTNBO60941 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
DTNBO60941 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
DTNBO60941 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
DTNBO60941 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms