Protein–RNA interactions for Protein: O00408

PDE2A, cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE2AO00408 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE2AO00408 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE2AO00408 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PDE2AO00408 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PDE2AO00408 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE2AO00408 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE2AO00408 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PDE2AO00408 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE2AO00408 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE2AO00408 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PDE2AO00408 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDE2AO00408 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDE2AO00408 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDE2AO00408 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PDE2AO00408 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE2AO00408 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PDE2AO00408 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE2AO00408 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE2AO00408 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE2AO00408 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PDE2AO00408 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PDE2AO00408 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE2AO00408 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE2AO00408 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE2AO00408 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE2AO00408 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PDE2AO00408 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE2AO00408 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PDE2AO00408 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PDE2AO00408 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE2AO00408 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PDE2AO00408 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE2AO00408 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PDE2AO00408 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE2AO00408 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PDE2AO00408 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE2AO00408 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PDE2AO00408 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE2AO00408 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE2AO00408 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE2AO00408 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE2AO00408 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PDE2AO00408 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PDE2AO00408 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE2AO00408 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE2AO00408 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE2AO00408 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PDE2AO00408 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE2AO00408 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE2AO00408 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDE2AO00408 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE2AO00408 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDE2AO00408 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE2AO00408 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDE2AO00408 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDE2AO00408 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDE2AO00408 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDE2AO00408 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE2AO00408 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE2AO00408 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDE2AO00408 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE2AO00408 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDE2AO00408 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE2AO00408 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE2AO00408 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDE2AO00408 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE2AO00408 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE2AO00408 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE2AO00408 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDE2AO00408 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PDE2AO00408 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDE2AO00408 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDE2AO00408 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PDE2AO00408 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDE2AO00408 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDE2AO00408 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE2AO00408 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PDE2AO00408 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PDE2AO00408 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE2AO00408 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE2AO00408 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PDE2AO00408 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDE2AO00408 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE2AO00408 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDE2AO00408 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE2AO00408 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE2AO00408 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PDE2AO00408 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE2AO00408 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PDE2AO00408 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE2AO00408 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PDE2AO00408 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PDE2AO00408 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE2AO00408 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PDE2AO00408 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE2AO00408 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PDE2AO00408 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE2AO00408 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE2AO00408 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDE2AO00408 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms