Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
C5orf58C9J3I9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C5orf58C9J3I9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C5orf58C9J3I9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C5orf58C9J3I9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C5orf58C9J3I9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C5orf58C9J3I9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C5orf58C9J3I9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
C5orf58C9J3I9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C5orf58C9J3I9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
C5orf58C9J3I9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
C5orf58C9J3I9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C5orf58C9J3I9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C5orf58C9J3I9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C5orf58C9J3I9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C5orf58C9J3I9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C5orf58C9J3I9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C5orf58C9J3I9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
C5orf58C9J3I9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C5orf58C9J3I9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C5orf58C9J3I9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C5orf58C9J3I9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C5orf58C9J3I9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C5orf58C9J3I9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C5orf58C9J3I9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C5orf58C9J3I9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C5orf58C9J3I9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C5orf58C9J3I9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C5orf58C9J3I9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C5orf58C9J3I9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C5orf58C9J3I9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C5orf58C9J3I9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C5orf58C9J3I9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C5orf58C9J3I9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C5orf58C9J3I9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C5orf58C9J3I9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C5orf58C9J3I9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C5orf58C9J3I9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C5orf58C9J3I9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C5orf58C9J3I9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C5orf58C9J3I9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C5orf58C9J3I9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C5orf58C9J3I9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C5orf58C9J3I9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C5orf58C9J3I9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C5orf58C9J3I9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C5orf58C9J3I9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C5orf58C9J3I9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C5orf58C9J3I9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C5orf58C9J3I9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C5orf58C9J3I9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C5orf58C9J3I9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C5orf58C9J3I9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C5orf58C9J3I9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C5orf58C9J3I9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C5orf58C9J3I9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
C5orf58C9J3I9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C5orf58C9J3I9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C5orf58C9J3I9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C5orf58C9J3I9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C5orf58C9J3I9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C5orf58C9J3I9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C5orf58C9J3I9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C5orf58C9J3I9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C5orf58C9J3I9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C5orf58C9J3I9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C5orf58C9J3I9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C5orf58C9J3I9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C5orf58C9J3I9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C5orf58C9J3I9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C5orf58C9J3I9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C5orf58C9J3I9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C5orf58C9J3I9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C5orf58C9J3I9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C5orf58C9J3I9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C5orf58C9J3I9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
C5orf58C9J3I9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C5orf58C9J3I9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C5orf58C9J3I9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C5orf58C9J3I9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C5orf58C9J3I9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C5orf58C9J3I9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C5orf58C9J3I9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C5orf58C9J3I9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C5orf58C9J3I9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C5orf58C9J3I9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C5orf58C9J3I9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C5orf58C9J3I9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C5orf58C9J3I9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C5orf58C9J3I9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C5orf58C9J3I9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C5orf58C9J3I9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C5orf58C9J3I9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C5orf58C9J3I9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C5orf58C9J3I9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C5orf58C9J3I9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C5orf58C9J3I9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C5orf58C9J3I9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C5orf58C9J3I9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C5orf58C9J3I9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms