Protein–RNA interactions for Protein: A6NNJ1

FAM90A9P, Putative protein FAM90A9P, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM90A9PA6NNJ1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM90A9PA6NNJ1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM90A9PA6NNJ1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM90A9PA6NNJ1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM90A9PA6NNJ1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM90A9PA6NNJ1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM90A9PA6NNJ1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM90A9PA6NNJ1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM90A9PA6NNJ1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM90A9PA6NNJ1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM90A9PA6NNJ1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM90A9PA6NNJ1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM90A9PA6NNJ1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM90A9PA6NNJ1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM90A9PA6NNJ1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM90A9PA6NNJ1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM90A9PA6NNJ1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM90A9PA6NNJ1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM90A9PA6NNJ1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM90A9PA6NNJ1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM90A9PA6NNJ1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM90A9PA6NNJ1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM90A9PA6NNJ1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM90A9PA6NNJ1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM90A9PA6NNJ1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM90A9PA6NNJ1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM90A9PA6NNJ1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM90A9PA6NNJ1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM90A9PA6NNJ1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM90A9PA6NNJ1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM90A9PA6NNJ1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM90A9PA6NNJ1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM90A9PA6NNJ1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM90A9PA6NNJ1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM90A9PA6NNJ1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM90A9PA6NNJ1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM90A9PA6NNJ1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM90A9PA6NNJ1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM90A9PA6NNJ1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM90A9PA6NNJ1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM90A9PA6NNJ1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM90A9PA6NNJ1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM90A9PA6NNJ1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM90A9PA6NNJ1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM90A9PA6NNJ1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM90A9PA6NNJ1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM90A9PA6NNJ1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM90A9PA6NNJ1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM90A9PA6NNJ1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM90A9PA6NNJ1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM90A9PA6NNJ1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM90A9PA6NNJ1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM90A9PA6NNJ1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FAM90A9PA6NNJ1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM90A9PA6NNJ1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM90A9PA6NNJ1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM90A9PA6NNJ1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM90A9PA6NNJ1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM90A9PA6NNJ1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM90A9PA6NNJ1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM90A9PA6NNJ1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM90A9PA6NNJ1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM90A9PA6NNJ1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM90A9PA6NNJ1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM90A9PA6NNJ1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM90A9PA6NNJ1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM90A9PA6NNJ1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM90A9PA6NNJ1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM90A9PA6NNJ1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM90A9PA6NNJ1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM90A9PA6NNJ1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM90A9PA6NNJ1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM90A9PA6NNJ1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM90A9PA6NNJ1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM90A9PA6NNJ1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM90A9PA6NNJ1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM90A9PA6NNJ1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM90A9PA6NNJ1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM90A9PA6NNJ1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM90A9PA6NNJ1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM90A9PA6NNJ1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM90A9PA6NNJ1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM90A9PA6NNJ1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM90A9PA6NNJ1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM90A9PA6NNJ1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM90A9PA6NNJ1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM90A9PA6NNJ1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM90A9PA6NNJ1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM90A9PA6NNJ1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM90A9PA6NNJ1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM90A9PA6NNJ1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM90A9PA6NNJ1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM90A9PA6NNJ1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM90A9PA6NNJ1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM90A9PA6NNJ1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM90A9PA6NNJ1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM90A9PA6NNJ1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM90A9PA6NNJ1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM90A9PA6NNJ1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM90A9PA6NNJ1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms