Protein–RNA interactions for Protein: A6NM45

CLDN24, Putative claudin-24, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN24A6NM45 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN24A6NM45 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN24A6NM45 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN24A6NM45 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN24A6NM45 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN24A6NM45 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN24A6NM45 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN24A6NM45 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN24A6NM45 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN24A6NM45 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN24A6NM45 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN24A6NM45 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN24A6NM45 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN24A6NM45 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN24A6NM45 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN24A6NM45 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN24A6NM45 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN24A6NM45 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN24A6NM45 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN24A6NM45 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDN24A6NM45 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN24A6NM45 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLDN24A6NM45 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLDN24A6NM45 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLDN24A6NM45 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLDN24A6NM45 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLDN24A6NM45 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLDN24A6NM45 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLDN24A6NM45 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN24A6NM45 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN24A6NM45 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN24A6NM45 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN24A6NM45 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN24A6NM45 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN24A6NM45 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN24A6NM45 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN24A6NM45 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN24A6NM45 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN24A6NM45 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN24A6NM45 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN24A6NM45 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN24A6NM45 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLDN24A6NM45 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN24A6NM45 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN24A6NM45 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN24A6NM45 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN24A6NM45 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN24A6NM45 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN24A6NM45 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN24A6NM45 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN24A6NM45 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN24A6NM45 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN24A6NM45 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN24A6NM45 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN24A6NM45 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN24A6NM45 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN24A6NM45 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN24A6NM45 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN24A6NM45 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN24A6NM45 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN24A6NM45 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN24A6NM45 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN24A6NM45 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN24A6NM45 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN24A6NM45 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN24A6NM45 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN24A6NM45 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN24A6NM45 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN24A6NM45 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN24A6NM45 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN24A6NM45 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN24A6NM45 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN24A6NM45 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN24A6NM45 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN24A6NM45 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN24A6NM45 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN24A6NM45 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN24A6NM45 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN24A6NM45 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN24A6NM45 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN24A6NM45 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN24A6NM45 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN24A6NM45 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN24A6NM45 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN24A6NM45 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN24A6NM45 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN24A6NM45 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN24A6NM45 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN24A6NM45 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN24A6NM45 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN24A6NM45 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN24A6NM45 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN24A6NM45 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN24A6NM45 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN24A6NM45 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN24A6NM45 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN24A6NM45 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN24A6NM45 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN24A6NM45 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN24A6NM45 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms