Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6X5

TRAV18, T-cell receptor alpha variable 18 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV18A0A075B6X5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAV18A0A075B6X5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAV18A0A075B6X5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAV18A0A075B6X5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAV18A0A075B6X5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAV18A0A075B6X5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRAV18A0A075B6X5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAV18A0A075B6X5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAV18A0A075B6X5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAV18A0A075B6X5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAV18A0A075B6X5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAV18A0A075B6X5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAV18A0A075B6X5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAV18A0A075B6X5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAV18A0A075B6X5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAV18A0A075B6X5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAV18A0A075B6X5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAV18A0A075B6X5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAV18A0A075B6X5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAV18A0A075B6X5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAV18A0A075B6X5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRAV18A0A075B6X5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAV18A0A075B6X5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAV18A0A075B6X5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAV18A0A075B6X5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAV18A0A075B6X5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAV18A0A075B6X5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAV18A0A075B6X5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAV18A0A075B6X5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAV18A0A075B6X5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAV18A0A075B6X5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAV18A0A075B6X5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAV18A0A075B6X5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAV18A0A075B6X5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAV18A0A075B6X5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAV18A0A075B6X5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAV18A0A075B6X5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAV18A0A075B6X5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAV18A0A075B6X5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAV18A0A075B6X5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAV18A0A075B6X5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAV18A0A075B6X5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAV18A0A075B6X5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAV18A0A075B6X5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAV18A0A075B6X5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAV18A0A075B6X5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAV18A0A075B6X5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAV18A0A075B6X5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAV18A0A075B6X5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAV18A0A075B6X5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAV18A0A075B6X5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAV18A0A075B6X5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAV18A0A075B6X5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAV18A0A075B6X5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAV18A0A075B6X5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAV18A0A075B6X5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAV18A0A075B6X5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAV18A0A075B6X5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAV18A0A075B6X5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAV18A0A075B6X5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAV18A0A075B6X5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAV18A0A075B6X5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAV18A0A075B6X5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAV18A0A075B6X5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAV18A0A075B6X5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAV18A0A075B6X5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAV18A0A075B6X5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAV18A0A075B6X5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAV18A0A075B6X5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAV18A0A075B6X5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAV18A0A075B6X5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAV18A0A075B6X5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAV18A0A075B6X5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAV18A0A075B6X5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAV18A0A075B6X5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAV18A0A075B6X5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAV18A0A075B6X5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAV18A0A075B6X5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAV18A0A075B6X5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAV18A0A075B6X5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAV18A0A075B6X5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAV18A0A075B6X5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAV18A0A075B6X5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAV18A0A075B6X5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAV18A0A075B6X5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAV18A0A075B6X5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAV18A0A075B6X5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAV18A0A075B6X5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAV18A0A075B6X5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAV18A0A075B6X5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAV18A0A075B6X5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAV18A0A075B6X5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAV18A0A075B6X5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAV18A0A075B6X5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAV18A0A075B6X5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAV18A0A075B6X5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAV18A0A075B6X5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAV18A0A075B6X5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAV18A0A075B6X5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAV18A0A075B6X5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms