Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN79

SOX13, Transcription factor SOX-13, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX13Q9UN79 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SOX13Q9UN79 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SOX13Q9UN79 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SOX13Q9UN79 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOX13Q9UN79 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOX13Q9UN79 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOX13Q9UN79 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOX13Q9UN79 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SOX13Q9UN79 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SOX13Q9UN79 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SOX13Q9UN79 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOX13Q9UN79 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOX13Q9UN79 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOX13Q9UN79 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOX13Q9UN79 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOX13Q9UN79 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOX13Q9UN79 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SOX13Q9UN79 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOX13Q9UN79 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SOX13Q9UN79 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOX13Q9UN79 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOX13Q9UN79 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOX13Q9UN79 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SOX13Q9UN79 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SOX13Q9UN79 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SOX13Q9UN79 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SOX13Q9UN79 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SOX13Q9UN79 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SOX13Q9UN79 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SOX13Q9UN79 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SOX13Q9UN79 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SOX13Q9UN79 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SOX13Q9UN79 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SOX13Q9UN79 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SOX13Q9UN79 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SOX13Q9UN79 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOX13Q9UN79 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOX13Q9UN79 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOX13Q9UN79 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOX13Q9UN79 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SOX13Q9UN79 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOX13Q9UN79 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SOX13Q9UN79 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SOX13Q9UN79 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SOX13Q9UN79 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SOX13Q9UN79 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SOX13Q9UN79 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SOX13Q9UN79 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SOX13Q9UN79 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SOX13Q9UN79 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SOX13Q9UN79 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SOX13Q9UN79 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SOX13Q9UN79 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SOX13Q9UN79 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SOX13Q9UN79 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SOX13Q9UN79 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SOX13Q9UN79 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SOX13Q9UN79 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SOX13Q9UN79 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SOX13Q9UN79 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SOX13Q9UN79 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SOX13Q9UN79 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SOX13Q9UN79 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SOX13Q9UN79 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SOX13Q9UN79 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SOX13Q9UN79 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SOX13Q9UN79 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SOX13Q9UN79 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SOX13Q9UN79 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SOX13Q9UN79 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SOX13Q9UN79 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SOX13Q9UN79 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SOX13Q9UN79 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SOX13Q9UN79 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SOX13Q9UN79 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SOX13Q9UN79 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX13Q9UN79 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX13Q9UN79 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SOX13Q9UN79 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SOX13Q9UN79 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SOX13Q9UN79 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SOX13Q9UN79 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SOX13Q9UN79 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SOX13Q9UN79 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SOX13Q9UN79 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SOX13Q9UN79 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SOX13Q9UN79 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SOX13Q9UN79 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SOX13Q9UN79 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SOX13Q9UN79 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SOX13Q9UN79 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SOX13Q9UN79 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SOX13Q9UN79 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SOX13Q9UN79 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SOX13Q9UN79 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SOX13Q9UN79 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SOX13Q9UN79 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SOX13Q9UN79 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SOX13Q9UN79 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SOX13Q9UN79 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms