Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OPN4Q9UHM6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
OPN4Q9UHM6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OPN4Q9UHM6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OPN4Q9UHM6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPN4Q9UHM6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPN4Q9UHM6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OPN4Q9UHM6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OPN4Q9UHM6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
OPN4Q9UHM6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OPN4Q9UHM6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
OPN4Q9UHM6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
OPN4Q9UHM6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
OPN4Q9UHM6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
OPN4Q9UHM6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
OPN4Q9UHM6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OPN4Q9UHM6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OPN4Q9UHM6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OPN4Q9UHM6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
OPN4Q9UHM6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OPN4Q9UHM6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OPN4Q9UHM6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OPN4Q9UHM6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OPN4Q9UHM6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPN4Q9UHM6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
OPN4Q9UHM6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OPN4Q9UHM6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OPN4Q9UHM6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OPN4Q9UHM6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OPN4Q9UHM6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OPN4Q9UHM6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OPN4Q9UHM6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
OPN4Q9UHM6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OPN4Q9UHM6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OPN4Q9UHM6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OPN4Q9UHM6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OPN4Q9UHM6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
OPN4Q9UHM6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OPN4Q9UHM6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OPN4Q9UHM6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OPN4Q9UHM6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OPN4Q9UHM6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
OPN4Q9UHM6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OPN4Q9UHM6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OPN4Q9UHM6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OPN4Q9UHM6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPN4Q9UHM6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPN4Q9UHM6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPN4Q9UHM6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OPN4Q9UHM6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OPN4Q9UHM6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OPN4Q9UHM6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
OPN4Q9UHM6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OPN4Q9UHM6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OPN4Q9UHM6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OPN4Q9UHM6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OPN4Q9UHM6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
OPN4Q9UHM6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OPN4Q9UHM6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OPN4Q9UHM6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
OPN4Q9UHM6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
OPN4Q9UHM6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OPN4Q9UHM6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
OPN4Q9UHM6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
OPN4Q9UHM6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OPN4Q9UHM6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OPN4Q9UHM6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
OPN4Q9UHM6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OPN4Q9UHM6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OPN4Q9UHM6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OPN4Q9UHM6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OPN4Q9UHM6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
OPN4Q9UHM6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OPN4Q9UHM6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OPN4Q9UHM6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OPN4Q9UHM6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OPN4Q9UHM6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OPN4Q9UHM6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OPN4Q9UHM6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OPN4Q9UHM6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
OPN4Q9UHM6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OPN4Q9UHM6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OPN4Q9UHM6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OPN4Q9UHM6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
OPN4Q9UHM6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OPN4Q9UHM6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OPN4Q9UHM6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OPN4Q9UHM6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OPN4Q9UHM6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OPN4Q9UHM6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OPN4Q9UHM6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OPN4Q9UHM6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OPN4Q9UHM6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OPN4Q9UHM6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OPN4Q9UHM6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OPN4Q9UHM6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OPN4Q9UHM6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OPN4Q9UHM6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OPN4Q9UHM6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OPN4Q9UHM6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms