Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF56

FBXL17, F-box/LRR-repeat protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL17Q9UF56 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXL17Q9UF56 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXL17Q9UF56 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXL17Q9UF56 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXL17Q9UF56 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXL17Q9UF56 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXL17Q9UF56 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXL17Q9UF56 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXL17Q9UF56 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXL17Q9UF56 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXL17Q9UF56 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXL17Q9UF56 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXL17Q9UF56 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXL17Q9UF56 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXL17Q9UF56 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXL17Q9UF56 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXL17Q9UF56 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXL17Q9UF56 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXL17Q9UF56 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXL17Q9UF56 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXL17Q9UF56 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXL17Q9UF56 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXL17Q9UF56 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXL17Q9UF56 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXL17Q9UF56 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXL17Q9UF56 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXL17Q9UF56 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FBXL17Q9UF56 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXL17Q9UF56 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXL17Q9UF56 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXL17Q9UF56 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXL17Q9UF56 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXL17Q9UF56 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXL17Q9UF56 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXL17Q9UF56 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXL17Q9UF56 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXL17Q9UF56 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXL17Q9UF56 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXL17Q9UF56 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXL17Q9UF56 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXL17Q9UF56 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXL17Q9UF56 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXL17Q9UF56 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXL17Q9UF56 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXL17Q9UF56 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXL17Q9UF56 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXL17Q9UF56 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXL17Q9UF56 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXL17Q9UF56 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXL17Q9UF56 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXL17Q9UF56 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXL17Q9UF56 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXL17Q9UF56 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXL17Q9UF56 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FBXL17Q9UF56 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FBXL17Q9UF56 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FBXL17Q9UF56 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FBXL17Q9UF56 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXL17Q9UF56 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FBXL17Q9UF56 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXL17Q9UF56 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FBXL17Q9UF56 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FBXL17Q9UF56 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXL17Q9UF56 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXL17Q9UF56 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXL17Q9UF56 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXL17Q9UF56 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXL17Q9UF56 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXL17Q9UF56 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXL17Q9UF56 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXL17Q9UF56 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXL17Q9UF56 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXL17Q9UF56 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXL17Q9UF56 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXL17Q9UF56 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXL17Q9UF56 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXL17Q9UF56 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXL17Q9UF56 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXL17Q9UF56 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXL17Q9UF56 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXL17Q9UF56 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXL17Q9UF56 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXL17Q9UF56 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXL17Q9UF56 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXL17Q9UF56 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXL17Q9UF56 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXL17Q9UF56 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXL17Q9UF56 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXL17Q9UF56 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXL17Q9UF56 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXL17Q9UF56 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXL17Q9UF56 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXL17Q9UF56 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXL17Q9UF56 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXL17Q9UF56 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXL17Q9UF56 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXL17Q9UF56 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL17Q9UF56 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXL17Q9UF56 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXL17Q9UF56 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms