Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL9Q9P2J3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL9Q9P2J3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL9Q9P2J3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL9Q9P2J3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL9Q9P2J3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KLHL9Q9P2J3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL9Q9P2J3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL9Q9P2J3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL9Q9P2J3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL9Q9P2J3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL9Q9P2J3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL9Q9P2J3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL9Q9P2J3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL9Q9P2J3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL9Q9P2J3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL9Q9P2J3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL9Q9P2J3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL9Q9P2J3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL9Q9P2J3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL9Q9P2J3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL9Q9P2J3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL9Q9P2J3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL9Q9P2J3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL9Q9P2J3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL9Q9P2J3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL9Q9P2J3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL9Q9P2J3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL9Q9P2J3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL9Q9P2J3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL9Q9P2J3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL9Q9P2J3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL9Q9P2J3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL9Q9P2J3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL9Q9P2J3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL9Q9P2J3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL9Q9P2J3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL9Q9P2J3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL9Q9P2J3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL9Q9P2J3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL9Q9P2J3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL9Q9P2J3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL9Q9P2J3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL9Q9P2J3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL9Q9P2J3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL9Q9P2J3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL9Q9P2J3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL9Q9P2J3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL9Q9P2J3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL9Q9P2J3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL9Q9P2J3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL9Q9P2J3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL9Q9P2J3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL9Q9P2J3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL9Q9P2J3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL9Q9P2J3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL9Q9P2J3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL9Q9P2J3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL9Q9P2J3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL9Q9P2J3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL9Q9P2J3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL9Q9P2J3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL9Q9P2J3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL9Q9P2J3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL9Q9P2J3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL9Q9P2J3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL9Q9P2J3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL9Q9P2J3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL9Q9P2J3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL9Q9P2J3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL9Q9P2J3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHL9Q9P2J3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL9Q9P2J3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL9Q9P2J3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL9Q9P2J3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL9Q9P2J3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL9Q9P2J3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL9Q9P2J3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL9Q9P2J3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL9Q9P2J3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL9Q9P2J3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL9Q9P2J3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL9Q9P2J3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL9Q9P2J3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL9Q9P2J3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLHL9Q9P2J3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL9Q9P2J3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL9Q9P2J3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL9Q9P2J3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL9Q9P2J3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL9Q9P2J3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL9Q9P2J3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL9Q9P2J3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL9Q9P2J3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL9Q9P2J3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL9Q9P2J3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL9Q9P2J3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL9Q9P2J3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL9Q9P2J3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL9Q9P2J3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms