Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX6

TMEM167B, Protein kish-B, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM167BQ9NRX6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM167BQ9NRX6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM167BQ9NRX6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM167BQ9NRX6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM167BQ9NRX6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM167BQ9NRX6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM167BQ9NRX6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM167BQ9NRX6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM167BQ9NRX6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM167BQ9NRX6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM167BQ9NRX6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM167BQ9NRX6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM167BQ9NRX6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM167BQ9NRX6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM167BQ9NRX6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM167BQ9NRX6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM167BQ9NRX6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM167BQ9NRX6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM167BQ9NRX6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM167BQ9NRX6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM167BQ9NRX6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM167BQ9NRX6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM167BQ9NRX6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM167BQ9NRX6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM167BQ9NRX6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM167BQ9NRX6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEM167BQ9NRX6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM167BQ9NRX6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM167BQ9NRX6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM167BQ9NRX6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM167BQ9NRX6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM167BQ9NRX6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM167BQ9NRX6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM167BQ9NRX6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM167BQ9NRX6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM167BQ9NRX6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM167BQ9NRX6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM167BQ9NRX6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM167BQ9NRX6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM167BQ9NRX6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM167BQ9NRX6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM167BQ9NRX6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM167BQ9NRX6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM167BQ9NRX6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM167BQ9NRX6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM167BQ9NRX6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM167BQ9NRX6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM167BQ9NRX6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM167BQ9NRX6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM167BQ9NRX6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM167BQ9NRX6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM167BQ9NRX6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM167BQ9NRX6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM167BQ9NRX6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM167BQ9NRX6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM167BQ9NRX6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM167BQ9NRX6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM167BQ9NRX6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM167BQ9NRX6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM167BQ9NRX6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM167BQ9NRX6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM167BQ9NRX6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM167BQ9NRX6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM167BQ9NRX6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM167BQ9NRX6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM167BQ9NRX6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM167BQ9NRX6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM167BQ9NRX6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM167BQ9NRX6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM167BQ9NRX6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM167BQ9NRX6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM167BQ9NRX6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM167BQ9NRX6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM167BQ9NRX6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM167BQ9NRX6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM167BQ9NRX6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMEM167BQ9NRX6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM167BQ9NRX6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM167BQ9NRX6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM167BQ9NRX6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM167BQ9NRX6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM167BQ9NRX6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM167BQ9NRX6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM167BQ9NRX6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM167BQ9NRX6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM167BQ9NRX6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM167BQ9NRX6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM167BQ9NRX6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM167BQ9NRX6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM167BQ9NRX6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM167BQ9NRX6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM167BQ9NRX6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM167BQ9NRX6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM167BQ9NRX6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM167BQ9NRX6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM167BQ9NRX6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM167BQ9NRX6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM167BQ9NRX6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM167BQ9NRX6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM167BQ9NRX6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms