Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX6

TMEM167B, Protein kish-B, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM167BQ9NRX6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM167BQ9NRX6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM167BQ9NRX6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM167BQ9NRX6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM167BQ9NRX6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM167BQ9NRX6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM167BQ9NRX6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM167BQ9NRX6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM167BQ9NRX6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM167BQ9NRX6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM167BQ9NRX6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM167BQ9NRX6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM167BQ9NRX6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM167BQ9NRX6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM167BQ9NRX6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM167BQ9NRX6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM167BQ9NRX6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEM167BQ9NRX6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM167BQ9NRX6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM167BQ9NRX6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM167BQ9NRX6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM167BQ9NRX6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM167BQ9NRX6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM167BQ9NRX6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM167BQ9NRX6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM167BQ9NRX6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TMEM167BQ9NRX6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM167BQ9NRX6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMEM167BQ9NRX6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMEM167BQ9NRX6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM167BQ9NRX6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM167BQ9NRX6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM167BQ9NRX6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM167BQ9NRX6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM167BQ9NRX6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM167BQ9NRX6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMEM167BQ9NRX6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM167BQ9NRX6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM167BQ9NRX6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM167BQ9NRX6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM167BQ9NRX6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM167BQ9NRX6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM167BQ9NRX6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM167BQ9NRX6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM167BQ9NRX6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM167BQ9NRX6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM167BQ9NRX6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM167BQ9NRX6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM167BQ9NRX6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM167BQ9NRX6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM167BQ9NRX6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM167BQ9NRX6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM167BQ9NRX6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM167BQ9NRX6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM167BQ9NRX6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM167BQ9NRX6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM167BQ9NRX6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM167BQ9NRX6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM167BQ9NRX6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM167BQ9NRX6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM167BQ9NRX6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM167BQ9NRX6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM167BQ9NRX6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM167BQ9NRX6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM167BQ9NRX6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM167BQ9NRX6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM167BQ9NRX6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM167BQ9NRX6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM167BQ9NRX6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM167BQ9NRX6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM167BQ9NRX6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM167BQ9NRX6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM167BQ9NRX6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM167BQ9NRX6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM167BQ9NRX6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM167BQ9NRX6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM167BQ9NRX6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM167BQ9NRX6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM167BQ9NRX6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM167BQ9NRX6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM167BQ9NRX6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM167BQ9NRX6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM167BQ9NRX6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM167BQ9NRX6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM167BQ9NRX6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM167BQ9NRX6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM167BQ9NRX6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM167BQ9NRX6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM167BQ9NRX6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM167BQ9NRX6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM167BQ9NRX6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM167BQ9NRX6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM167BQ9NRX6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM167BQ9NRX6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM167BQ9NRX6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM167BQ9NRX6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM167BQ9NRX6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM167BQ9NRX6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM167BQ9NRX6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM167BQ9NRX6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms