Protein–RNA interactions for Protein: Q9H930

SP140L, Nuclear body protein SP140-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140LQ9H930 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SP140LQ9H930 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SP140LQ9H930 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SP140LQ9H930 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SP140LQ9H930 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SP140LQ9H930 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SP140LQ9H930 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SP140LQ9H930 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SP140LQ9H930 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SP140LQ9H930 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SP140LQ9H930 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SP140LQ9H930 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SP140LQ9H930 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SP140LQ9H930 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SP140LQ9H930 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SP140LQ9H930 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SP140LQ9H930 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SP140LQ9H930 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SP140LQ9H930 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SP140LQ9H930 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SP140LQ9H930 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SP140LQ9H930 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP140LQ9H930 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SP140LQ9H930 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP140LQ9H930 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SP140LQ9H930 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SP140LQ9H930 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SP140LQ9H930 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SP140LQ9H930 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SP140LQ9H930 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SP140LQ9H930 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SP140LQ9H930 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SP140LQ9H930 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SP140LQ9H930 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SP140LQ9H930 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SP140LQ9H930 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SP140LQ9H930 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SP140LQ9H930 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SP140LQ9H930 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SP140LQ9H930 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SP140LQ9H930 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SP140LQ9H930 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SP140LQ9H930 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SP140LQ9H930 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SP140LQ9H930 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SP140LQ9H930 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SP140LQ9H930 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SP140LQ9H930 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SP140LQ9H930 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SP140LQ9H930 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SP140LQ9H930 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SP140LQ9H930 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SP140LQ9H930 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SP140LQ9H930 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SP140LQ9H930 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SP140LQ9H930 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SP140LQ9H930 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SP140LQ9H930 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SP140LQ9H930 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP140LQ9H930 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SP140LQ9H930 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SP140LQ9H930 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SP140LQ9H930 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SP140LQ9H930 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SP140LQ9H930 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SP140LQ9H930 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SP140LQ9H930 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SP140LQ9H930 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SP140LQ9H930 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SP140LQ9H930 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SP140LQ9H930 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SP140LQ9H930 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SP140LQ9H930 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SP140LQ9H930 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SP140LQ9H930 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SP140LQ9H930 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SP140LQ9H930 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SP140LQ9H930 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SP140LQ9H930 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SP140LQ9H930 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SP140LQ9H930 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SP140LQ9H930 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SP140LQ9H930 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SP140LQ9H930 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SP140LQ9H930 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SP140LQ9H930 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SP140LQ9H930 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP140LQ9H930 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP140LQ9H930 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP140LQ9H930 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SP140LQ9H930 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP140LQ9H930 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SP140LQ9H930 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SP140LQ9H930 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP140LQ9H930 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SP140LQ9H930 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP140LQ9H930 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SP140LQ9H930 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP140LQ9H930 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SP140LQ9H930 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms