Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2Y9

SLCO5A1, Solute carrier organic anion transporter family member 5A1, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO5A1Q9H2Y9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLCO5A1Q9H2Y9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLCO5A1Q9H2Y9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLCO5A1Q9H2Y9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLCO5A1Q9H2Y9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLCO5A1Q9H2Y9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLCO5A1Q9H2Y9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLCO5A1Q9H2Y9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLCO5A1Q9H2Y9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLCO5A1Q9H2Y9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLCO5A1Q9H2Y9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLCO5A1Q9H2Y9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLCO5A1Q9H2Y9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLCO5A1Q9H2Y9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLCO5A1Q9H2Y9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLCO5A1Q9H2Y9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLCO5A1Q9H2Y9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLCO5A1Q9H2Y9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLCO5A1Q9H2Y9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLCO5A1Q9H2Y9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLCO5A1Q9H2Y9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLCO5A1Q9H2Y9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLCO5A1Q9H2Y9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLCO5A1Q9H2Y9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLCO5A1Q9H2Y9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLCO5A1Q9H2Y9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLCO5A1Q9H2Y9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLCO5A1Q9H2Y9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLCO5A1Q9H2Y9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLCO5A1Q9H2Y9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLCO5A1Q9H2Y9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLCO5A1Q9H2Y9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLCO5A1Q9H2Y9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLCO5A1Q9H2Y9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLCO5A1Q9H2Y9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLCO5A1Q9H2Y9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLCO5A1Q9H2Y9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLCO5A1Q9H2Y9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLCO5A1Q9H2Y9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLCO5A1Q9H2Y9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLCO5A1Q9H2Y9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLCO5A1Q9H2Y9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLCO5A1Q9H2Y9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLCO5A1Q9H2Y9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLCO5A1Q9H2Y9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLCO5A1Q9H2Y9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLCO5A1Q9H2Y9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLCO5A1Q9H2Y9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLCO5A1Q9H2Y9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLCO5A1Q9H2Y9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLCO5A1Q9H2Y9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLCO5A1Q9H2Y9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLCO5A1Q9H2Y9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLCO5A1Q9H2Y9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLCO5A1Q9H2Y9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLCO5A1Q9H2Y9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLCO5A1Q9H2Y9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLCO5A1Q9H2Y9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLCO5A1Q9H2Y9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLCO5A1Q9H2Y9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLCO5A1Q9H2Y9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLCO5A1Q9H2Y9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLCO5A1Q9H2Y9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLCO5A1Q9H2Y9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLCO5A1Q9H2Y9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLCO5A1Q9H2Y9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLCO5A1Q9H2Y9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLCO5A1Q9H2Y9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLCO5A1Q9H2Y9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLCO5A1Q9H2Y9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLCO5A1Q9H2Y9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLCO5A1Q9H2Y9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLCO5A1Q9H2Y9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLCO5A1Q9H2Y9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLCO5A1Q9H2Y9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLCO5A1Q9H2Y9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLCO5A1Q9H2Y9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLCO5A1Q9H2Y9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLCO5A1Q9H2Y9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLCO5A1Q9H2Y9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLCO5A1Q9H2Y9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLCO5A1Q9H2Y9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLCO5A1Q9H2Y9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLCO5A1Q9H2Y9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLCO5A1Q9H2Y9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLCO5A1Q9H2Y9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLCO5A1Q9H2Y9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLCO5A1Q9H2Y9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLCO5A1Q9H2Y9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLCO5A1Q9H2Y9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLCO5A1Q9H2Y9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLCO5A1Q9H2Y9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLCO5A1Q9H2Y9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLCO5A1Q9H2Y9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLCO5A1Q9H2Y9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLCO5A1Q9H2Y9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SLCO5A1Q9H2Y9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLCO5A1Q9H2Y9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLCO5A1Q9H2Y9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLCO5A1Q9H2Y9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms