Protein–RNA interactions for Protein: Q9H161

ALX4, Homeobox protein aristaless-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX4Q9H161 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALX4Q9H161 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALX4Q9H161 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALX4Q9H161 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALX4Q9H161 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALX4Q9H161 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALX4Q9H161 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX4Q9H161 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ALX4Q9H161 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALX4Q9H161 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ALX4Q9H161 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALX4Q9H161 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALX4Q9H161 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALX4Q9H161 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALX4Q9H161 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALX4Q9H161 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALX4Q9H161 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALX4Q9H161 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALX4Q9H161 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ALX4Q9H161 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALX4Q9H161 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALX4Q9H161 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALX4Q9H161 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALX4Q9H161 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALX4Q9H161 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALX4Q9H161 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALX4Q9H161 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALX4Q9H161 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALX4Q9H161 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALX4Q9H161 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALX4Q9H161 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALX4Q9H161 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALX4Q9H161 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALX4Q9H161 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALX4Q9H161 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALX4Q9H161 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ALX4Q9H161 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALX4Q9H161 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALX4Q9H161 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALX4Q9H161 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALX4Q9H161 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALX4Q9H161 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALX4Q9H161 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ALX4Q9H161 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ALX4Q9H161 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALX4Q9H161 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ALX4Q9H161 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALX4Q9H161 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ALX4Q9H161 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALX4Q9H161 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALX4Q9H161 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ALX4Q9H161 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALX4Q9H161 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALX4Q9H161 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALX4Q9H161 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALX4Q9H161 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALX4Q9H161 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALX4Q9H161 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALX4Q9H161 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX4Q9H161 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX4Q9H161 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALX4Q9H161 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALX4Q9H161 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALX4Q9H161 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALX4Q9H161 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALX4Q9H161 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALX4Q9H161 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALX4Q9H161 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALX4Q9H161 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALX4Q9H161 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALX4Q9H161 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALX4Q9H161 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALX4Q9H161 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALX4Q9H161 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ALX4Q9H161 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALX4Q9H161 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALX4Q9H161 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALX4Q9H161 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALX4Q9H161 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ALX4Q9H161 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALX4Q9H161 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALX4Q9H161 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ALX4Q9H161 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALX4Q9H161 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ALX4Q9H161 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ALX4Q9H161 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX4Q9H161 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ALX4Q9H161 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
ALX4Q9H161 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ALX4Q9H161 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ALX4Q9H161 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ALX4Q9H161 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX4Q9H161 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX4Q9H161 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX4Q9H161 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX4Q9H161 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ALX4Q9H161 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALX4Q9H161 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALX4Q9H161 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ALX4Q9H161 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms