Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMMD5Q9GZQ3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMMD5Q9GZQ3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMMD5Q9GZQ3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMMD5Q9GZQ3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMMD5Q9GZQ3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMMD5Q9GZQ3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMMD5Q9GZQ3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMMD5Q9GZQ3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMMD5Q9GZQ3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMMD5Q9GZQ3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMMD5Q9GZQ3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COMMD5Q9GZQ3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COMMD5Q9GZQ3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COMMD5Q9GZQ3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COMMD5Q9GZQ3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COMMD5Q9GZQ3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COMMD5Q9GZQ3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COMMD5Q9GZQ3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COMMD5Q9GZQ3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COMMD5Q9GZQ3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COMMD5Q9GZQ3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COMMD5Q9GZQ3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COMMD5Q9GZQ3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COMMD5Q9GZQ3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMMD5Q9GZQ3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMMD5Q9GZQ3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COMMD5Q9GZQ3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COMMD5Q9GZQ3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COMMD5Q9GZQ3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COMMD5Q9GZQ3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMMD5Q9GZQ3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMMD5Q9GZQ3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COMMD5Q9GZQ3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COMMD5Q9GZQ3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COMMD5Q9GZQ3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COMMD5Q9GZQ3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COMMD5Q9GZQ3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMMD5Q9GZQ3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD5Q9GZQ3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMMD5Q9GZQ3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMMD5Q9GZQ3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMMD5Q9GZQ3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMMD5Q9GZQ3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMMD5Q9GZQ3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMMD5Q9GZQ3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMMD5Q9GZQ3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMMD5Q9GZQ3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COMMD5Q9GZQ3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COMMD5Q9GZQ3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
COMMD5Q9GZQ3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COMMD5Q9GZQ3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COMMD5Q9GZQ3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COMMD5Q9GZQ3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COMMD5Q9GZQ3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COMMD5Q9GZQ3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD5Q9GZQ3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD5Q9GZQ3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COMMD5Q9GZQ3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COMMD5Q9GZQ3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COMMD5Q9GZQ3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COMMD5Q9GZQ3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COMMD5Q9GZQ3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COMMD5Q9GZQ3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COMMD5Q9GZQ3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COMMD5Q9GZQ3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COMMD5Q9GZQ3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COMMD5Q9GZQ3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COMMD5Q9GZQ3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COMMD5Q9GZQ3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COMMD5Q9GZQ3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COMMD5Q9GZQ3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
COMMD5Q9GZQ3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COMMD5Q9GZQ3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COMMD5Q9GZQ3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COMMD5Q9GZQ3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COMMD5Q9GZQ3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COMMD5Q9GZQ3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COMMD5Q9GZQ3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COMMD5Q9GZQ3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COMMD5Q9GZQ3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COMMD5Q9GZQ3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COMMD5Q9GZQ3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COMMD5Q9GZQ3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COMMD5Q9GZQ3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COMMD5Q9GZQ3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COMMD5Q9GZQ3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COMMD5Q9GZQ3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COMMD5Q9GZQ3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COMMD5Q9GZQ3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COMMD5Q9GZQ3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
COMMD5Q9GZQ3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COMMD5Q9GZQ3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COMMD5Q9GZQ3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COMMD5Q9GZQ3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COMMD5Q9GZQ3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COMMD5Q9GZQ3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
COMMD5Q9GZQ3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COMMD5Q9GZQ3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COMMD5Q9GZQ3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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