Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COMMD5Q9GZQ3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COMMD5Q9GZQ3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COMMD5Q9GZQ3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
COMMD5Q9GZQ3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COMMD5Q9GZQ3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COMMD5Q9GZQ3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COMMD5Q9GZQ3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COMMD5Q9GZQ3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COMMD5Q9GZQ3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COMMD5Q9GZQ3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
COMMD5Q9GZQ3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
COMMD5Q9GZQ3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COMMD5Q9GZQ3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COMMD5Q9GZQ3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COMMD5Q9GZQ3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COMMD5Q9GZQ3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COMMD5Q9GZQ3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COMMD5Q9GZQ3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
COMMD5Q9GZQ3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COMMD5Q9GZQ3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COMMD5Q9GZQ3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COMMD5Q9GZQ3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COMMD5Q9GZQ3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COMMD5Q9GZQ3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COMMD5Q9GZQ3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COMMD5Q9GZQ3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COMMD5Q9GZQ3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COMMD5Q9GZQ3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COMMD5Q9GZQ3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COMMD5Q9GZQ3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COMMD5Q9GZQ3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COMMD5Q9GZQ3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COMMD5Q9GZQ3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COMMD5Q9GZQ3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COMMD5Q9GZQ3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COMMD5Q9GZQ3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COMMD5Q9GZQ3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COMMD5Q9GZQ3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COMMD5Q9GZQ3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COMMD5Q9GZQ3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
COMMD5Q9GZQ3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COMMD5Q9GZQ3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COMMD5Q9GZQ3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COMMD5Q9GZQ3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COMMD5Q9GZQ3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COMMD5Q9GZQ3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COMMD5Q9GZQ3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COMMD5Q9GZQ3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COMMD5Q9GZQ3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
COMMD5Q9GZQ3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
COMMD5Q9GZQ3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COMMD5Q9GZQ3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COMMD5Q9GZQ3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COMMD5Q9GZQ3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COMMD5Q9GZQ3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COMMD5Q9GZQ3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COMMD5Q9GZQ3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COMMD5Q9GZQ3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COMMD5Q9GZQ3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COMMD5Q9GZQ3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COMMD5Q9GZQ3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COMMD5Q9GZQ3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COMMD5Q9GZQ3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COMMD5Q9GZQ3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COMMD5Q9GZQ3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COMMD5Q9GZQ3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COMMD5Q9GZQ3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COMMD5Q9GZQ3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COMMD5Q9GZQ3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COMMD5Q9GZQ3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COMMD5Q9GZQ3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COMMD5Q9GZQ3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COMMD5Q9GZQ3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COMMD5Q9GZQ3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COMMD5Q9GZQ3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COMMD5Q9GZQ3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COMMD5Q9GZQ3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COMMD5Q9GZQ3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COMMD5Q9GZQ3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COMMD5Q9GZQ3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COMMD5Q9GZQ3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COMMD5Q9GZQ3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COMMD5Q9GZQ3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COMMD5Q9GZQ3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COMMD5Q9GZQ3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
COMMD5Q9GZQ3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COMMD5Q9GZQ3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COMMD5Q9GZQ3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COMMD5Q9GZQ3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COMMD5Q9GZQ3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COMMD5Q9GZQ3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COMMD5Q9GZQ3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COMMD5Q9GZQ3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COMMD5Q9GZQ3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COMMD5Q9GZQ3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COMMD5Q9GZQ3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COMMD5Q9GZQ3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COMMD5Q9GZQ3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COMMD5Q9GZQ3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
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