Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU5

NEDD4L, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4LQ96PU5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD4LQ96PU5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD4LQ96PU5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NEDD4LQ96PU5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD4LQ96PU5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD4LQ96PU5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEDD4LQ96PU5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD4LQ96PU5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEDD4LQ96PU5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEDD4LQ96PU5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD4LQ96PU5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEDD4LQ96PU5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEDD4LQ96PU5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD4LQ96PU5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEDD4LQ96PU5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEDD4LQ96PU5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD4LQ96PU5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEDD4LQ96PU5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD4LQ96PU5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD4LQ96PU5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEDD4LQ96PU5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD4LQ96PU5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEDD4LQ96PU5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD4LQ96PU5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEDD4LQ96PU5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEDD4LQ96PU5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD4LQ96PU5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEDD4LQ96PU5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD4LQ96PU5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD4LQ96PU5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD4LQ96PU5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NEDD4LQ96PU5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD4LQ96PU5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NEDD4LQ96PU5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD4LQ96PU5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEDD4LQ96PU5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD4LQ96PU5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEDD4LQ96PU5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD4LQ96PU5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEDD4LQ96PU5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD4LQ96PU5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD4LQ96PU5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD4LQ96PU5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NEDD4LQ96PU5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD4LQ96PU5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEDD4LQ96PU5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD4LQ96PU5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEDD4LQ96PU5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD4LQ96PU5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEDD4LQ96PU5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEDD4LQ96PU5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD4LQ96PU5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD4LQ96PU5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD4LQ96PU5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD4LQ96PU5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD4LQ96PU5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD4LQ96PU5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD4LQ96PU5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD4LQ96PU5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD4LQ96PU5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD4LQ96PU5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD4LQ96PU5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD4LQ96PU5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD4LQ96PU5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD4LQ96PU5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD4LQ96PU5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD4LQ96PU5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD4LQ96PU5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD4LQ96PU5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD4LQ96PU5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD4LQ96PU5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD4LQ96PU5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD4LQ96PU5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD4LQ96PU5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD4LQ96PU5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD4LQ96PU5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEDD4LQ96PU5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD4LQ96PU5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD4LQ96PU5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEDD4LQ96PU5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD4LQ96PU5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEDD4LQ96PU5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD4LQ96PU5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEDD4LQ96PU5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEDD4LQ96PU5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD4LQ96PU5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEDD4LQ96PU5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD4LQ96PU5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD4LQ96PU5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD4LQ96PU5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEDD4LQ96PU5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEDD4LQ96PU5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD4LQ96PU5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD4LQ96PU5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NEDD4LQ96PU5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD4LQ96PU5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD4LQ96PU5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NEDD4LQ96PU5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD4LQ96PU5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NEDD4LQ96PU5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 300.1 ms